python - 从 numpy 数组到 itk Image

Question

我有一个 numpy 数组，想将其转换为 ITK 图像以进行进一步处理。如何在不使用 WrapITK 的 PyBuffer 扩展的情况下做到这一点。我不能使用它，因为我在编译时遇到了一堆错误：

.../ExternalProjects/PyBuffer/itkPyBuffer.txx: In static member function ‘static PyObject* itk::PyBuffer<TImage>::GetArrayFromImage(TImage*) [with TImage = itk::Image<float, 2u>]’:
.../ExternalProjects/PyBuffer/wrap_itkPyBufferPython.cxx:1397:   instantiated from here
.../ExternalProjects/PyBuffer/itkPyBuffer.txx:64: error: cannot convert ‘int*’ to ‘npy_intp*’ in argument passing

我可以使用有关如何修复编译错误或其他方式来转换我的 python 对象的想法。

Answer 1

只是改变

int dimensions[ ImageDimension ];

到

npy_intp dimensions[ ImageDimension ];

并重新编译。

Answer 2

您可能对最近发生的 SimpleITK 工作非常感兴趣。

www.simpleitk.org 上有很多信息。

可以在http://www.github.com/SimpleITK找到源代码和许多文档。

Answer 3

在模块/外部的 ITK 源代码树中克隆PyBuffer 存储库。然后在您的 CMake 配置中启用它。