8

我正在尝试使用 java 或 python 将 HL7 v2.x 消息转换为 FHIR JSON。但我无法找到任何解决方案。有什么办法可以做到这一点？

我发现 FHIR 能够转换为 JSON，但我不知道该怎么做。

4

4 回答 4

7

关于 HL7 2.x

HL7 2.x 版本既不支持 XML 也不支持 JSON作为标准的一部分。

HL7 版本 2.5 及更早版本的版本 2 v2.xml XML 模式由 Sun Microsystems 提供。提供这些表示是为了方便，因为 XML 模式是描述 XML 表示的紧凑且特定的方式。然而，模式本身并不是本规范的规范部分。
hl7.org

正如您在上面看到的，“v2.xml XML 模式”不是规范的一部分。它们是额外的贡献。

本规范的目的是为 HL7 版本 2.3.1、2.4、2.5 和未来的 2.x 消息提供基于可扩展标记语言 XML 的编码规则，可在发送者和接收者都理解 XML 的环境中使用。v2.xml规范旨在充当v2.3.1、v.2.4 和 v2.5（以及 HL7 v2.x 标准的未来版本）的第二种规范编码。
hl7.org

以下是来自维基百科的引用：

HL7 v2.x 消息使用基于段（行）和单字符分隔符
wikipedia的非 XML 编码语法

关于 HL7 v3.x

HL7 v3.x 版本支持 XML 作为标准的一部分。

几种 XML 编码方法可以用作 HL7 V3 消息的消息传递语法。本文档代表 HL7 推荐的方法，描述了基本规则和原则。本规范所需的相应数据类型描述在数据类型 XML ITS 中进行了描述。
hl7.org

以下是“HL7 V3指南”的引用：

HL7 在抽象级别定义其消息。HL7 中的“7”代表 ISO 通信模型的应用级别——ISO 级别 7。这个级别强调消息的语义内容，而不是它们是如何表示的，也不是这些表示是如何被编码以进行传输的。

HL7 在抽象级别定义其消息。HL7 中的“7”代表 ISO 通信模型的应用级别——ISO 级别 7。这个级别强调消息的语义内容，而不是它们是如何表示的，也不是这些表示是如何被编码以进行传输的。

HL7 版本 2 抽象消息模型具有段和字段的概念。它定义了一种特定的编码方案来表示抽象消息的实例——所谓的“垂直条编码”。来自 Health 域（语义级别 7）的信息在版本 2 中表示为段和字段，并表示为带有大量竖线的 ASCII 字符。与这种方法一致，V2 的新 XML 编码大多是对竖线编码的直接替代

第 3 版抽象消息模型基于 RIM。HL7 版本 3 消息可以被认为是 RIM 对象图从发送者到接收者的通信。ITS 可以通过对对象、属性和数据类型进行适当的表示来最好地处理表示这些消息。
hl7.ihelse.net

以下是来自维基百科的引用：

HL7 v3 消息基于 XML 编码语法
wikipedia

您可以在此处阅读有关兼容性的更多信息。

它们都不支持将 JSON 作为标准的一部分。
因此，从 HL7 到 XML 或 HL7 到 JSON 的转换是不符合标准的；需要自己处理。

关于 FHIR（快速医疗保健互操作性资源）

FHIR 是由 HL7 发布的医疗保健数据交换标准。在此处
查看 HL7 和 FHIR 之间的关系。

作为标准的一部分， FHIR支持XML和JSON格式。请参阅这些链接以获取更多详细信息。

将 v2 转换为 FHIR：

大致有两种方法可以进行这种转换：

  • 创建反映 v2 消息内容的 FHIR 消息包，旨在作为等效表示，其行为方式与 v2 消息相同
  • 使用 v2 消息的内容来更新 FHIR 服务器——可能提取 Encounter 资源或创建一个 Bundle，该 Bundle 旨在充当针对 FHIR 服务器的“事务”包。我认为这将是一个更常见的用例。

FHIR 博客

有关转换的详细信息，请阅读该博客。社区正在努力转换；希望开箱即用的解决方案很快就会可用。

v2 和 FHIR 之间的转换是社区正在努力的事情——这里有一个聊天流：https ://chat.fhir.org/#narrow/stream/179188-v2-to.20FHIR ，您可以在其中参与。两个标准之间的映射将需要一些工作来定义，并且在实现中会有差异，但该项目的目标是定义一个“基础”映射作为起点。v2 和 FHIR 之间的关系相当密切，但还有很多问题需要解决……</p>

没有单一的方法可以实际执行转换——这取决于您必须掌握的技术。例如，在这篇文章中，我在 NodeRED 中使用了简单的 javascript——尽管只是作为概念证明。我想大多数集成引擎供应商都会在这个领域提供产品。
评论

映射详细信息在HL7 站点上进行了说明。

以下是一些工具：

https://github.com/rimiti/hl7-object-parser#hl7-object-parser（HL7 v2.x 转 JSON）
https://github.com/nezt/hl72xml#hl72xml（HL7 V2.x 转 XML）
https://github.com/KevinMayfield/ITKHL7v2-FHIR

Mirth 提供了将 HL7 转换为 XML/JSON 的功能。
请参阅@Bryan 的其他答案。
很少有样品可以在这里和这里找到。

于 2020-03-04T14:00:17.897 回答
7

这是一个建议：

  1. 下载并安装 Mirth Connect
  2. 创建一个新频道
  3. 在“脚本”选项卡下，选择“预处理器”
  4. 使用以下命令将 HL7 消息转换为 XML：

// Modify the message variable below to pre process data
message = SerializerFactory.getSerializer('HL7V2').toXML(message);
    
return message;

  1. 现在您在变量message中有 XML 文件，因此您可以编写内联代码将其转换为 JSON，而无需从此处获取库：https ://davidwalsh.name/convert-xml-json
于 2016-11-10T22:35:40.477 回答
2

在 Mirth 中，您可以在源转换器中使用以下代码

var jsonString = XmlUtil.toJson(msg)
var data = JSON.parse(data)
于 2021-05-19T17:16:06.350 回答
1

您可以使用Apache Camel在 Java 中将 HL7 转换为 FHIR JSON 。Camel 支持两种格式：

确切的实现取决于您如何接收和发送 HL7 和 FHIR；但从广义上讲，您将编写一个Camel 路由，该路由使用 HL7 数据格式组件从 HL7解组，然后通过使用自定义类将源字段映射到目标字段将数据转换为目标 FHIR Java 对象（您需要编写这个，但是请参阅下面的起点），然后使用 FHIR 数据格式将数据编组为 JSON。例如：

from("file:/input/directory")
    .unmarshal().hl7() // convert from HL7 text format to Java object
    .process(new PatientProcessor()) // map source to target fields
    .marshal().fhirJson() // serialise out to FHIR JSON format
    .to("file:/output/directory");

中间的处理器是您的转换/映射类所在的位置。

Camel 的单元测试中有一个完整的示例，展示了如何从 HL7 转换为 FHIR。看：

于 2020-03-10T16:48:20.853 回答