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我是 R 新手，非常感谢您的帮助。我有一个约束的优化问题。尽管有几种方法可以解决 R 中的优化问题，但我无法使用需要应用的约束正确表达我的问题。

假设我有以下三类数据：

A<-c(99.1,  96.5,   94.4,   92.7,   91.5,   91.3,   91.4,   90.1,   87.1,   82.6,   76.4)
B<-c(146.4, 140.2,  133.6,  126.5,  118.7,  109.4,  101.2,  101.8,  103.7,  102.5,  98.3)
C<-c(237.5, 213.9,  191,    168.9,  147.4,  124.9,  108.3,  95.7,   84.4,   73.5,   63)
t<-seq(1:11)
DT<-cbind.data.frame(t,A,B,C)

我想将指数函数y(t)拟合到每个类别中的数据点（最小化平方误差），以便选择y(t)_c > y(t)_b > y(t)_a > 0 t [1;15]

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2 回答 2

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我不会尝试将约束合并到回归中。只需构建三个单独的回归：

fit_loga <- lm(y ~ log(A) + t, data=DT) 
fit_logb <- lm(y ~ log(B) + t, data=DT) 
fit_logc <- lm(y ~ log(C) + t, data=DT)

fit_a <- exp(A)
fit_b <- exp(B)
fit_c <- exp(C)

然后验证它们是否满足该范围内各处的约束（或至少在每个整数数据点）(fit_c > fit_b) & (fit_b > fit_a)：。只有没有，我们才会担心。就像将 t 中的一些其他项放入模型中，也许exp(t), I(t^2), poly(t, <order>)...

编辑：我不知道solnp包裹。

于 2016-10-20T22:15:11.693 回答
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我认为人们使用的错误消息solnp主要是指约束不足。此外，正如文档中所述，需要将所有参数放在一个向量中。在对代码进行适当调整后，我能够y(t)_c > y(t)_b > y(t)_a > 0直接实现我的约束，而无需更改问题。最方便的方法是对求解器使用矩阵形式。使用上面的数据，我得到以下 结果： 这里显示的结果

library(data.table)
library(Rsolnp)

t<-as.vector(10:20)
DT<-cbind.data.frame(A,B,C)
tlogDT<-transpose(log(DT))

# min[log(y)'- Ax-b]
# Arr = [A1 A2 .. An b1 b2 .. bn]

gofn = function(arrin)
{
  arr = cbind(arrin[1:3],arrin[4:6])
  sum(
    (as.matrix(arr[,1])%*%t + arr[,2] - tlogDT)^2
  )
}

nocross=t #defines the times where the curves are not allowed to intersect
ineqfn2=function(arrin)
{
  #constrains:
  # 0<f_a(t)<f_b(t)<f_c(t), for some t,
  arr = cbind(arrin[1:3],arrin[4:6])
  nextarr=as.matrix(rbind(rep(0,2),arr[1:(length(arr[,1])-1),]))
  ineqmat=as.matrix(arr[,1])%*%nocross+arr[,2]-nextarr[,1]%*%nocross-nextarr[,2]
  as.vector(t(ineqmat))
}

#lines should be aligned with the first startvalue
eqfn = function(arrin)
{  
  arr = cbind(arrin[1:3],arrin[4:6])
  arr[,1]*t[1]+arr[,2]-tlogDT[,1]
}
#start values:
An=c(1,1,1)
bn=tlogDT[,1]
vstart=c(An,bn)

r <- solnp(
  vstart,  gofn,

  eqfun = eqfn, eqB= c(0,0,0),

  ineqfun = ineqfn2,
  ineqLB = rep(0,length(DT[1,])*length(nocross)),
  ineqUB = rep(5000,length(DT[1,])*length(nocross))
)

r$pars[1]
line1 = exp(r$pars[4]+r$pars[1]*t)
line2 = exp(r$pars[5]+r$pars[2]*t)
line3 = exp(r$pars[6]+r$pars[3]*t)

plot(t, DT[,3],log = "y")
points(t, DT[,2],col="green")
points(t, DT[,1],col="blue")

lines(t, line1,lwd=2, col = "blue",  xlab = "Time (s)", ylab = "Counts")
lines(t, line2,lwd=2, col = "green",  xlab = "Time (s)", ylab = "Counts")
lines(t, line3,lwd=2, col = "black",  xlab = "Time (s)", ylab = "Counts")
于 2016-10-26T21:56:32.627 回答