python - 如何将 bjson 结构反序列化为棉花糖模式

Question

我正在尝试将 bjson 结构转换为棉花糖库中的模式。

下面是棉花糖模式：

class GeneSchema(Schema):
"""description of class"""

   id_entrez = fields.Integer(required = True, error_messages={'required': "The 'id_entrez' field is requeired."})
   symbol = fields.String()

   @validates('id_entrez')
   def validate_id_entrez(self, data):
       if data <= 0:
          raise ValidationError("The 'id_entrez' field must be greater than zero.")

下面是 bjson 将被转换为模式：

[{"symbol": "VAMP4", "_id": {"$oid": "57ae3b175a945932fcbdf41d"}, "id_entrez": 8674}, {"symbol": "CCT5", "_id": {"$oid": "57ae3b175a945932fcbdf41e"}, "id_entrez": 22948}]

请注意，bjson 的“_id”为 ObjectId - “$oid”。这是因为使用 mongodb 的查询结果。

请问，有谁知道为什么不正确地从 bjson 转换为 marshmallow 模式？

谢谢你们！

Answer 1

我不知道这个问题是否仍然有效，但我想展示我的解决方案，如何将 ObjectId 推送到 Marshmallow 模式：

我只是使用预处理方法pre_load 将 ObjectId 转换为 String：

@pre_load
def convert_objectid(self, in_data, **kwargs):
    if "_id" in in_data:
        in_data["_id"] = str(in_data["_id"])
    return in_data

Answer 2

您仍然可以使用您的模式来解析 MongoDB 输出，只需忽略额外的“_id”字段。另一方面，如果您确实想解析该“_id”，只需在您的架构中添加额外的非必需字段。