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我是 knime 新手,我正在尝试将这个* OpenMS 质谱工作流程重新创建为 OpenMS-Knime 工作流程。OpenMS 工作流程最初是在 OpenMS 命令行中手动执行的。

论文指出,我现在遇到的问题是......

[OpenMS PeakPickerHiRes用于计算] 轮廓质谱峰的质心,禁用信噪比过滤器...

因此,OpenMS 的 Knime 实现具有正确的 PeakPickerRes 节点,以及所有正确的配置参数。但是,算法过滤器似乎没有简单地被“禁用”的选项。它具有配置项,也许可以设置为使其或多或少不起作用,但我想知道是否有办法手动编辑节点(通过代码或其他方法)以完全禁用该功能。

Knime 节点配置窗口

  • 张等人。2014 - DeMix 工作流程,用于在高分辨率数据相关串联质谱法中有效识别共片段肽
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