pubmed - 通过 pubmed api 发布的类似 pubmed 文章

Question

给定 pmid 是否可以获得类似的 pubmed 文章。示例此链接显示右侧的类似文章。

Answer 1

您可以使用NCBI API使用 BioPython 来完成。您要查找的命令是neighbor_score. 或者，您可以直接通过URL获取数据。

from Bio import Entrez

Entrez.email = "Your.Name.Here@example.org"
handle = Entrez.elink(db="pubmed", id="26998445", cmd="neighbor_score", rettype="xml")
records = Entrez.read(handle)

scores = sorted(records[0]['LinkSetDb'][0]['Link'], key=lambda k: int(k['Score']))
#show the top 5 results
for i in range(1, 6):
    handle = Entrez.efetch(db="pubmed", id=scores[-i]['Id'], rettype="xml")
    record = Entrez.read(handle)
    print(record)