我正在尝试以 sdf 格式从 pubchem 数据库中提取与某个精确质量匹配的化合物的化学结构，并且在该精确质量的 10ppm 范围内（精确质量-cmpndmass/精确质量）* 10 ^ 6。有没有办法使用与 pubchem 交互的 python 或 java 编程语言来实现这一点。
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PubChem 有一个 REST API 来下载化学结构。为了检索给定质量范围内的 PubChem 化合物记录，应启动 Entrez 查询以生成 CID 列表。100:100.01 是示例的质量范围。
http://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/esearch.fcgi?db=pccompound&usehistory=y&retmax=0&term=100:100.01[exactmass]
您可以参考本教程 高级用户网关
于 2017-01-30T04:43:59.433 回答