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我有两个 MR 采集，第一个是 3D 采集（1x1x1 mm3），第二个是 2D 采集（2.24 x 2.24 x 5.00 mm，轴向切片）。高分辨率数据集是一个完整的头部 3D 采集，如果在轴向方向上重新切片（方向最初是采集中的矢状），则可提供 176 个切片。2D 采集仅包含 3 个轴向切片，这些切片被选择以针对大脑中的特定区域并连续采集。

是否有可能知道 3D 高分辨率数据集中的哪些切片与 2D 数据集中的 3 个切片准确对应，假设受试者在两次扫描之间没有移动，并且这些数据集是在同一扫描会话中获取的？我正在查看这两个数据集的 dicom，并尝试使用 ImageOrientationPatient 和 ImagePositionPatient 标签来尝试准确找出二维扫描中切片相对于磁体等中心的坐标。这样我就可以知道 2D 采集中第一个切片相对于磁体等中心的精确坐标，并假设两次扫描共享相同的原点，然后我可以确切地知道坐标对应于 3D 扫描中的哪个轴向切片？我面临的问题是两次采集的 ImageOrientationPatient 向量是不同的，因为高分辨率是通过矢状方向规范获得的（尽管是 3d 并且可以在任何方向获得切片），而 2D 数据是专门作为轴向切片采集的。

有dicom处理经验的人能否请教一下我如何链接这两个扫描？由于它是相同的扫描会话，我假设这两个采集的参考位置应该相同。那是对的吗？

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只有在一次扫描中拍摄了所有图像时，ImagePositionPatient 才能可靠地引用相同的坐标系。不幸的是，没有“对患者进行校准”可以确保特定坐标始终参考同一患者的同一位置。

假设您的扫描就是这种情况，那么任务非常简单。每次扫描的完整几何结构定义为：

  • ImagePositionPatient (0020,0032) - 每个切片左上角像素的坐标

  • ImageOrientationPatient (0020,0037) - 每个切片的方向向量，即像素行和列对齐的轴

  • PixelSpacing (0028,0030) - 每个像素的高度和宽度（是的，y 维度首先出现！）

现在您已经精确地知道了两次扫描中每个切片的每个像素的位置，剩下的任务就是在 3D 扫描的维度中表示 2D 扫描的左上角像素。我会使用坐标变换来做到这一点，但其他方法也可以。

于 2016-05-03T06:29:50.217 回答