r - 如何应用漂亮的 LDplot？

Question

我有如下数据。我发现我的数据（染色体位置）之间存在连锁不平衡（LD），现在我喜欢绘制像热图或其他显示列 S1 和 S2 之间关系的图。

输入：

           S1        S2          R^2
1 10 73576307   11 308290 9.648065e-05
2 10 73576307   11 309127 5.023692e-04
3   11 308290   11 309127 3.927666e-01
4 10 73576307 1 158813819 1.227192e-04
5   11 308290 1 158813819 1.404745e-03

提前感谢您的帮助。