r - 从数据库获取数据时连接丢失

Question

我有一个从 mysql 服务器获取数据的函数。我使用这样的公式来做到这一点：

sql <- sprintf("SELECT * FROM `match_player` INNER JOIN `match` ON match_player.match_id=match.id")
df_all <- dbGetQuery(con, sql)

这一切都有效。但是，我必须对 +/- 200.000 行执行计算，并且对于每一行，我都必须从数据库中获取数据。在 +/- 100.000 条记录之后，我收到一个错误，导致连接丢失：

.local(conn, statement, ...) 中的错误：无法运行语句：查询期间丢失与 MySQL 服务器的连接

关于如何确保我不会失去联系的任何想法

Answer 1

延迟，但可能有帮助：这看起来像是最近 DBI 和 RMySQL 版本中的已知回归，可能通过降级修复：https ://github.com/rstats-db/RMySQL/issues/190