我正在尝试为具有 53 个 obs 的数据框修复 glmm。17 个变量。所有变量都是标准化的,但不遵循正态分布且没有缺失值。数据框的 str() 如下所示。
- 物种:因子 w/ 19 水平“spp1”,“spp2”,..:5 18 12 15 19 4 6 14 16 5 ...
- 关联:因子 w/ 4 个级别“assoA”,“assoB”,..:1 1 2 2 2 3 3 4 4 1 ...
- 站点:因子 w/ 2 个级别 "site1","site2": 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 ...
- obs.no : int 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
- 特征1:数字0.652 0.428 0.535 0.389 0.486 ...
- 特征2:数量 0.135 0.16 0.134 0.142 0.159
- (剪裁 trait3 到 13)
我执行了以下代码来检查站点之间的重要性以及给定特征的关联类。
model1= glmer(trait1 ~ association+site+ (1 | species),data=df6,family=gaussian)
并收到下面给出的错误。
在 glmer(trait1 ~ association+site+ (1 | species),data=df6, : 不推荐使用 family=gaussian (身份链接) 调用 glmer() 作为 lmer() 的快捷方式;请直接调用 lmer()
在此之后,我想用 Gauss-Hermite 正交估计参数。非常感谢任何修复此错误和执行 Gauss-Hermite 正交的代码的建议。