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我有这段代码，用于在 for 循环环境中使用函数“cop.theta”从一些计算中创建矩阵

Mat.corr <- matrix(0,6,5,byrow=F)
for (i in 1:6){
Mat.corr[i,]=cop.theta(index,EXPR,SURV=survp[,i])
}

我使用 doParallel 包中的“foreach”编写了一个 R 代码，以获得类似于上面代码生成的结果。我的代码如下

library(doParallel)
cl <- makeCluster(3) 
registerDoParallel(cl)
getDoParWorkers()
clusterExport(cl, list("QT","EXPR","cop.theta.i"))
clusterEvalQ(cl, library(copula))

foreach(i=1:6,.combine=matrix(0,6,5,byrow=F) %dopar%
Mat.corr[i,]=cop.theta(index,EXPR,QT=survp[,i])

但我收到了这个错误

Error: unexpected '=' in "foreach(i=1:6,.combine=matrix(0,6,5,byrow=F)
%dopar%  Mat.corr[i,]="

我哪里错了？

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2 回答 2

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旁边有一个“）” byrow = F，即

foreach(i=1:6,.combine=matrix(0,6,5,byrow=F)) %dopar%
  Mat.corr[i,]=cop.theta(index,EXPR,QT=survp[,i])

应该修复这个错误。但是，请注意，只要您并行运行循环，循环mat.corr[i,]=...内部foreach就不会将操作产生的值写入此特定行 - 这仅适用于单核。这意味着，您必须使用内部或循环完成后处理合并过程。这是一个代码片段来澄清我的观点。cop.thetaforeach.combineforeach()

mat <- matrix(nrow = 3, ncol = 3)

### multi-core -----
foreach(i = 1:nrow(mat)) %dopar% {
  mat[i, ] <- matrix(rep(i, ncol(mat)), nrow = 1)
}

mat
     [,1] [,2] [,3]
[1,]   NA   NA   NA
[2,]   NA   NA   NA
[3,]   NA   NA   NA


### single core -----
foreach(i = 1:nrow(mat)) %do% {
  mat[i, ] <- matrix(rep(i, ncol(mat)), nrow = 1)
}

mat
     [,1] [,2] [,3]
[1,]    1    1    1
[2,]    2    2    2
[3,]    3    3    3
于 2016-04-06T10:07:06.437 回答
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谢谢大家的意见。下面的代码实际上已经回答了我的问题。

foreach(i=1:6,.combine=rbind) %dopar%  cop.theta(index,EXPR,SURV=survp[,i])
于 2016-04-06T16:07:03.437 回答