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我正在尝试从在 Eclipse 中作为 TomCat 7.0 上的 IDE 运行的 Java Servlet 运行一些 R 代码。

END 目标是创建一个在TOMCAT或JETTY上运行的网站，以显示使用现有 R 代码制作的图形 + 数据，R 函数以 Base 64 代码形式返回，并结合一些现有 Java 和 Python 函数处理和创建高级 Excel 文件的结果实例。

（由于很多原因，我不会使用 R Shiny Server，所以我想从 Java 运行 R / Python）

为了获得基本设置，我创建了一个动态 Web 项目，其中包含一个简单的 servlet 和一个可以运行 R 代码的 test.java 文件。

测试.java：

public class test {
      public static void main(String[] args) throws Exception {
          System.out.println(DoR.collectR());
      }
}

DoR.java：

import javax.script.ScriptEngine;
import javax.script.ScriptEngineManager;
import javax.script.ScriptException;

public class DoR {

  public static Object collectR() {
    ScriptEngineManager manager = new ScriptEngineManager();
    ScriptEngine engine = manager.getEngineByName("Renjin");
    if(engine == null) {
        throw new RuntimeException("Renjin Script Engine not found on the classpath.");
    }
    Object catchR = "XX";
    try {
        catchR = engine.eval("df <- data.frame(x=1:10, y=(1:10)+rnorm(n=10));"
                + "print(df);"
                + "print(lm(y ~ x, df))");
    } catch (ScriptException e) {
        e.printStackTrace();
    }
    return catchR;
   }
}

StartTestServlet.java：

import java.io.IOException;
import javax.servlet.ServletException;
import javax.servlet.annotation.WebServlet;
import javax.servlet.http.HttpServlet;
import javax.servlet.http.HttpServletRequest;
import javax.servlet.http.HttpServletResponse;

@WebServlet("/StartTestServlet")
public class StartTestServlet extends HttpServlet {
  private static final long serialVersionUID = 1L;

  public StartTestServlet() {
    super();
  }

  protected void doGet(HttpServletRequest request, HttpServletResponse response) throws ServletException, IOException {
    //response.getWriter().append("Served at: ").append(request.getContextPath()).append((CharSequence) DoR.collectR());
    response.getWriter().append("Served at: ").append(request.getContextPath());
  }

  protected void doPost(HttpServletRequest request, HttpServletResponse response) throws ServletException, IOException {
    doGet(request, response);
  }
}

我安装了库：

renjin-script-engine-0.7.0-RC2.jar
renjin-studio-0.8.1915-jar-with-dependencies.jar
slf4j-api-1.7.19.jar
slf4j-simple-1.7.19.jar

如果我将 test.java 作为 Java 应用程序运行，它可以正常工作。

如果我在 TomCat 7.0 服务器上运行 servlet，它工作正常（没有 .append((CharSequence) DoR.collectR()) ）

如果我使用 .append((CharSequence) DoR.collectR()) 运行代码，我会得到异常：

java.lang.RuntimeException: Renjin Script Engine not found on the classpath.
    ......DoR.collectR(DoR.java:16)
    ......StartTestServlet.doGet(StartTestServlet.java:19)
    javax.servlet.http.HttpServlet.service(HttpServlet.java:621)
    javax.servlet.http.HttpServlet.service(HttpServlet.java:728)
    org.apache.tomcat.websocket.server.WsFilter.doFilter(WsFilter.java:51)

DoR.java:16 是一行：

try {

StartTestServlet.doGet(StartTestServlet.java:19) 是一行：

response.getWriter().append("Served at: ").append(request.getContextPath()).append((CharSequence) DoR.collectR());

我一直在尝试各种方法以使其在 Eclipse 版本中正常工作：Mars.1 Release (4.5.1) 并从 Renjin / 搜索互联网等下载了示例文件，但到目前为止还没有运气让 R 代码运行从 Servlet 内部。

我忽略了一些简单的事情还是我需要做完全不同的事情？

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1 回答 1

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请参阅Renjin 示例中的（新添加的）eclipse-dynamic-web-project。总结自述文件：

  1. 从 Renjin 下载页面下载独立的 renjin-script-engine-0.8.1931-jar-with-dependencies.jar 。您似乎正在将旧版本的 renjin-script-engine 与 GUI jar 结合起来。
  2. 将此 JAR 复制到 WebContent/WEB-INF/lib 以便它与您的应用程序一起部署。

另请查看您的“DoR”方法：您正在调用print()哪个将其输出发送到标准输出并返回NULL。在网络服务器上，这可能会被发送到日志中，但肯定不会在对客户端的响应中结束。

如果要将lm()函数的结果发送到客户端，可以使用 rjson::toJSON() 序列化它，例如。

于 2016-04-02T20:29:57.057 回答