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我正在开发一种基因应用程序。用户将选择要搜索的数据库文件。

系统应该这样做：

  1. 找到以前版本的数据库文件。
  2. 找出 2 个数据库文件之间的差异。
  3. 将差异放在第三个文件中。
  4. 然后对新文件（第三个）执行搜索。

数据库文件很大（300 GB 基因组数据）。我使用 Windows 作为操作系统，我的应用程序是用 js、PHP、Perl 和 HTML 编写的。

找出这些文件之间差异的最佳方法是什么？

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