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我正在尝试使用 linux 无头运行 Netlogo,以便将作业发送到集群。我以前从未使用过 linux,但我试图按照这里的说明进行操作(http://netlogo-users.18673.x6.nabble.com/Running-NetLogo-Headless-in-Behaviorspace-Sample-code-td4862232.html)。

#!/bin/bash
#SBATCH -N 1
#SBATCH -n 1  
#SBATCH -c 7
module load netlogo/5.3.1-64
~/netlogo-5.3.1-64/netlogo-headless.sh \
-- model /cluster/home/rfuda01/UM_model.nlogo \
--experiment UM
--table /cluster/home/rfuda01/UM_test.csv

当我提交作业时,输出文件包含一条错误消息:

line 7: /cluster/home/rfuda01/netlogo-5.3.1-64/netlogo-headless.sh: No such file or directory

我看到这个文件不在我指定的文件夹中,但是我看到的在集群上使用 NetLogo 的每个示例都引用了这个脚本。我在哪里可以找到该文件的正确路径?

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netlogo-headless.sh在 5.3.0 中无意中从 Linux 安装中删除:https ://github.com/NetLogo/NetLogo/issues/979

目前,您可以使用5.2.1

实际上,您可能可以直接netlogo-headless.sh从 5.2.1 下载并将其放入 5.3.1 中而不会出现问题,但我尚未对此进行测试。

netlogo-headless.sh编辑:如果你把旧的放在app/NetLogo 主目录下的目录中,它应该可以工作。谢谢尼古拉斯!

于 2016-03-25T21:53:50.443 回答