我使用 git 已经有一段时间了，但最近才开始使用 packrat。我希望我的存储库是自包含的，但同时我不想包含 CRAN 包，因为它们是可用的。似乎一旦在带有 packrat 的项目中打开 R，它就会尝试使用项目库中的包；如果它们不可用，那么它将尝试从项目库中的 src 安装；如果它们不可用，它将查看该计算机中安装的库。如果计算机中没有可用的库；接下来会看 CRAN 吗？
我应该在我的 git repo 中至少包含哪些文件（例如，packrat.lock）？
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您可以选择使用您希望项目可用的包的源 tarball 及其版本来设置一个类似 CRAN 的外部存储库。但是，默认行为是接下来查看 CRAN，正如您在问题中所确定的那样。查看 packrat.lock 文件，您会看到对于您在 packrat 中使用的每个包，都有一个名为的选项source: CRAN（如果您已经从 CRAN 下载了该文件）。
当您有本地存储的包源文件时，该包的锁定内容将更改为以下内容：
Package: FooPackage
Source: source
Version: 0.4-4
Hash: 44foo4036fb68e9foo9027048d28
SourcePath: /Users/MyName/Documents/code/myrepo/RNetica
我对你的最后一个问题有点不清楚：What files should I include in my git repo as a minimum (e.g., packrat.lock)?但我将把它视为 a) 应该存在哪些文件以供 packrat 运行的组合，以及 b) 这些文件中的哪些应该提交给 git-repo。为了回答第一个问题，我在现有 R 项目上初始化 Packrat 进行说明。
当您运行 时packrat::init()，会发生两件重要的事情（除其他外）： 1. 所有的 Packrat 脚手架，包括源 tarball 等都在以下目录下创建：PackageName/packrat/. 2.packrat/lib*/添加到您的 .gitignore 文件中。
所以从这里，我们可以看到下面的任何东西packrat/lib*/都不需要提交给你的 git-repo。这留下了以下 3 个要提交的文件：
packrat/init.Rpackrat/packrat.lockpackrat/packrat.opts
packrat.lock需要通过版本控制系统与他人协作；它有助于使您的私人图书馆保持同步。packrat.opts允许您为 Packrat 指定不同的项目特定选项。该文件是使用get_opts和自动生成的set_opts。将此文件提交到 git-repo 将确保为所有协作者维护您指定的任何选项。要提交到 repo 的最终文件是.Rprofile. 该文件告诉 R 使用私有包库（当 R 从项目目录启动时）。
根据您的需要，您可以选择是否将源 tar 包提交到存储库。如果您不希望它们在您的 git-repo 中可用，您只需添加packrat/src/到 .gitignore。但是，这意味着任何访问 git-repo 的人都无法访问包源代码，并且文件将从 CRAN 或文件中源代码行指示的任何位置下载packrat.lock。
从您的问题来看，听起来将packrat/src/文件夹内容提交到您的存储库可能是您需要的。
于 2016-08-15T03:45:01.650 回答