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我一直在尝试在 R 中使用 Ensemble 方法,并在BostonHousing2数据集上尝试插入符号模型的集合。在设置贪心合奏和线性合奏时,我得到一个错误。代码如下:

library(caret)
library(caretEnsemble)
library(mlbench)
data(BostonHousing2)
X <- model.matrix(cmedv~crim+zn+indus+chas+nox+rm+age+dis+
                rad+tax+ptratio+b+lstat+lat+lon, BostonHousing2)[,-1]
X <- data.frame(X)
Y <- BostonHousing2$cmedv
train <- runif(nrow(X)) <= 0.7
folds=5
repeats=1
myControl <- trainControl(method='cv', number=folds, repeats=repeats, returnResamp='none', 
                      returnData=FALSE, savePredictions=TRUE, 
                      verboseIter=TRUE, allowParallel=TRUE,
                      index=createMultiFolds(Y[train], k=folds, times=repeats))
PP <- c('center', 'scale')
model1 <- train(X[train,], Y[train], method='gbm', trControl=myControl,
            tuneGrid=expand.grid(.n.trees=500, .interaction.depth=15, .shrinkage = 0.01))
model2 <- train(X[train,], Y[train], method='blackboost', trControl=myControl)
model3 <- train(X[train,], Y[train], method='parRF', trControl=myControl)
model4 <- train(X[train,], Y[train], method='mlpWeightDecay', trControl=myControl, trace=FALSE, preProcess=PP)
model5 <- train(X[train,], Y[train], method='ppr', trControl=myControl, preProcess=PP)
model6 <- train(X[train,], Y[train], method='earth', trControl=myControl, preProcess=PP)
model7 <- train(X[train,], Y[train], method='glm', trControl=myControl, preProcess=PP)
model8 <- train(X[train,], Y[train], method='svmRadial', trControl=myControl, preProcess=PP)
model9 <- train(X[train,], Y[train], method='gam', trControl=myControl, preProcess=PP)
model10 <- train(X[train,], Y[train], method='glmnet', trControl=myControl, preProcess=PP)
all.models <- list(model1, model2, model3, model4, model5, model6, model7, model8, model9, model10)
names(all.models) <- sapply(all.models, function(x) x$method)
sort(sapply(all.models, function(x) min(x$results$RMSE)))
greedy <- caretEnsemble(all.models, iter=1000L)
Error: is(list_of_models, "caretList") is not TRUE

有几个我被卡住的情况:在设置 model1 时,我收到以下错误消息:

The tuning parameter grid should have columns n.trees, interaction.depth, shrinkage, n.minobsinnode

此外,在设置贪婪集成和线性集成时,组合模型时出现列表错误。请请求一些帮助。

PS:道歉,如果这些需要是单独的问题。

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3 回答 3

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您必须使用该函数caretlist()来创建可以传递给的插入符号模型列表,caretEnsemble如下面的小插图示例所示:

model_list <- caretList(
  Class~., data=training,
  trControl=my_control,
  methodList=c("glm", "rpart")
  )

回答您的第二个问题,您希望以下行做什么?

expand.grid(.n.trees=500, .interaction.depth=15, .shrinkage = 0.01)

您可以测试它只是三个值的单个组合。您应该在任何列中至少有两个值,以生成超过 1 个参数值组合以进行调整。另外,为什么名字有一个额外的“。” (点)开头?

于 2016-03-17T08:05:15.397 回答
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回答第二部分:

method="gbm" 的更新版本需要在 tuneGrid 中存在 n.trees、interaction.depth、shrinkage、n.minobsinnode。

tuneGrid=expand.grid(.n.trees=500, .interaction.depth=6, .shrinkage = 0.01,.n.minobsinnode = c(10))

在上述情况下可以正常工作。

于 2016-04-18T04:19:32.377 回答
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如果我们使用以下代码将普通列表的“all.models”转换为 Caret_List ,它就会起作用 -

类(all.models)<-“caretList”

谢谢!

于 2016-10-17T10:03:49.207 回答