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我有一套积分cloub(积分cloub的数量≈200万)。我想为点 cloub 中的每个点找到最近的 k 邻居。我做了这样的事情

flann::Index flann_index(data_m, flann::KDTreeIndexParams(),cvflann::FLANN_DIST_EUCLIDEAN);// create the object of flann
    for (int i = 0; i < numberOfPointsInPointCloub; i++){
    flann_index.knnSearch(data_m.row(i), indices, dists,num_of_knn); //each row is a new set of point in 3D
    ..//save the results "dist" and "indices" in somewhere else
}

但这运行得很慢。在 for 循环中,它运行 1000 次,持续 20 秒,非常慢。我用错了吗?或者有什么方法可以加快速度吗?

更新:我需要搜索的查询点正是用于构建树的点,我需要为树中的每个点找到最近的 k 个邻居,因此我从数据的每一行中获取点并执行knn搜索。

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我最近也有类似的问题。这里有一些想法:

首先,确保您处于发布模式。未优化的代码会严重影响性能。我最近的测试显示,从调试代码切换到发布代码后,性能提高了 70 倍。

其次,您使用的是flann::KDTreeIndexParams()的默认值,即 4 棵树。为了提高速度,您可以将其减少到 1。这可能会降低准确性,但有助于提高性能。

第三,至少在 OpenCV 的最新版本中,knnSearch 函数还有第五个参数,即SearchParams()。它的构造函数的第一个参数“指定索引中的树应该被递归遍历的次数”,可以修改以平衡性能和准确性。有关详细信息,请参阅OpenCV 文档

第四,您似乎一次搜索一个查询点的邻居。尝试一次运行多个查询点。返回参数“indices”和“dists”将是矩阵,其中每行 r 表示索引 r 处的点的邻居(每行的第一个元素表示查询点本身)。

最后,如果这还不够快,也许可以查看VCG ibrary 中的 KdTree 实现。到目前为止,我已经看到发布模式的性能提升超过 OpenCV 的 FLANN 的 2 倍。您也可以尝试并行化,但只有在您从非并行版本中获得尽可能多的性能后,我才会走这条路。

于 2016-03-10T17:11:56.510 回答