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我正在使用partykit并注意到可能的varid不匹配(除非我误解了什么)。下面是示例代码。

由返回的根节点将nodeapply变量 5 显示为拆分变量。

显式生成的列表的第一个元素也有split$varid5。如果我们查看iris数据框,那么第 5 列是Species,并且Petal.Width是第 4 列,它应该是对象varid所示的根节点j48_party

似乎varid使用了+1的实际功能,这是故意的吗?

> library(partykit)
> library(RWeka)
> data("iris")
> j48 <- J48(Species~., data=iris)
> j48_party <- as.party(j48)
> j48_party

Model formula:
Species ~ Sepal.Length + Sepal.Width + Petal.Length + Petal.Width

Fitted party:
[1] root
|   [2] Petal.Width <= 0.6: setosa (n = 50, err = 0.0%)
|   [3] Petal.Width > 0.6
|   |   [4] Petal.Width <= 1.7
|   |   |   [5] Petal.Length <= 4.9: versicolor (n = 48, err = 2.1%)
|   |   |   [6] Petal.Length > 4.9
|   |   |   |   [7] Petal.Width <= 1.5: virginica (n = 3, err = 0.0%)
|   |   |   |   [8] Petal.Width > 1.5: versicolor (n = 3, err = 33.3%)
|   |   [9] Petal.Width > 1.7: virginica (n = 46, err = 2.2%)

Number of inner nodes:    4
Number of terminal nodes: 5
> colnames(iris)
[1] "Sepal.Length" "Sepal.Width"  "Petal.Length" "Petal.Width"  "Species"     
> nodeapply(j48_party)
$`1`
[1] root
|   [2] V5 <= 0.6 *
|   [3] V5 > 0.6
|   |   [4] V5 <= 1.7
|   |   |   [5] V4 <= 4.9 *
|   |   |   [6] V4 > 4.9
|   |   |   |   [7] V5 <= 1.5 *
|   |   |   |   [8] V5 > 1.5 *
|   |   [9] V5 > 1.7 *

> nodes <- as.list(j48_party$node)
> nodes[[1]]$split$varid
[1] 5
4

1 回答 1

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不同之处在于:J48()与大多数其他建模函数(如lm()glm()等)一样,它不是简单地直接使用data提供的,而是首先构建一个model.frame. 这已经执行了变量转换(例如,获取日志,创建因子或Surv()对象),收集可能不在调用环境中data但在调用环境中的变量,并忽略不在模型中的变量formula等。有关?model.frame更多信息和链接,请参阅。

因此,由创建的对象J48()有一个model.frame不完全是iris数据,但响应变量被移动到第一列:

head(model.frame(j48))
##   Species Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width
## 1  setosa          5.1         3.5          1.4         0.2
## 2  setosa          4.9         3.0          1.4         0.2
## 3  setosa          4.7         3.2          1.3         0.2
## 4  setosa          4.6         3.1          1.5         0.2
## 5  setosa          5.0         3.6          1.4         0.2
## 6  setosa          5.4         3.9          1.7         0.4

并且由此产生的信息也被传递给party对象。

j48_party$data
## [1] Species      Sepal.Length Sepal.Width  Petal.Length Petal.Width 
## <0 rows> (or 0-length row.names)

[注意:在这种情况下,J48()只存储元信息,但删除实际数据,因为这里不需要它。但是ctree(),例如,这是不同的。]

要看到这model.frame()可能与原始数据不同,请考虑以下情况:我们创建一个新noise变量,它属于iris调用环境,而只是在调用环境中,获取日志并省略几个变量:

set.seed(1) 
noise <- rnorm(150)
j48 <- J48(Species ~ log(Petal.Width) + noise, data = iris)
j48_party <- as.party(j48)
head(model.frame(j48))
##   Species log(Petal.Width)      noise
## 1  setosa       -1.6094379 -0.6264538
## 2  setosa       -1.6094379  0.1836433
## 3  setosa       -1.6094379 -0.8356286
## 4  setosa       -1.6094379  1.5952808
## 5  setosa       -1.6094379  0.3295078
## 6  setosa       -0.9162907 -0.8204684
j48_party$data
## [1] Species          log(Petal.Width) noise           
## <0 rows> (or 0-length row.names)
于 2016-03-02T12:06:52.997 回答