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抱歉，如果这个问题以前出现过，但我想问一下是否有人知道maxent()dismo 包中每个参数的内容？我搜索了各种 R 论坛站点和 R 帮助页面本身，但我不明白如何提出我的论点。我在这里有一个用于预测变量的数据框样本

library(dismo)
system.file("java", package="dismo")

bio_14  bio_19  bio_3   bio_5   forest_cover
9       125     67      329     1
9       125     67      329     1
9       124     68      329     3
10      126     67      319     3

每行要么是背景点，要么是存在点。之后我不明白的是maxent()公式中的 p 和 a 参数。p 参数是否包含 x 和 y 坐标以及指示 1（存在）和 0（不存在）的第 3 列？还是包含 1 和 0 的列改为 a 参数？forest_cover是一个分类变量。

DataM<-read.csv("Maxent dataset.csv", header=T)
DataM<-data.frame(DataM)
parg<-read.csv("maxent p arg.csv", header=T)
aarg<-read.csv("maxent a arg.csv", header=T)
DataM[,'forest_cover'] = as.factor(DataM[,'forest_cover'])

#p
x           y
328206.7075 1257255.387
328759.7075 1256632.385
323102.7012 1256404.391
323029.7117 1267187.402



#a
pb
1
1
1
0


#Final code
    maxent1<-maxent(x=DataM, p=parg, a=aarg, factors='forest_cover')

    Error in maxent(x = DataM, p = parg, a = aarg, factors = "forest_cover") : 
  unused arguments (x = DataM, p = parg, a = aarg, factors = "forest_cover")

请告诉我是否应该移动一些东西，以及它们是否在正确的数据框中。提前致谢

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我不知道这是否会有所帮助，但我的代码如下所示。您可以如下设置您的参数。如果您打开 maxent.jar 并单击 MaxEnt GUI 中的帮助按钮，您将获得一个参数列表。只需输入参数的名称并设置它的值，它就可以工作了。

  `xx<-maxent(x=expl,p=spp.coords$garmani, args=c(
  'maximumbackground=10000',
  'defaultprevalence=1.00',
  'betamultiplier=0.5',
  'pictures=true',
  'randomtestpoints=30',
  'linear=true',
  'quadratic=true',
  'product=true',
  'threshold=true',
  'hinge=true',
  'threads=2',
  'responsecurves=false',
  'jackknife=false',
  'askoverwrite=false'
))`

编辑：我应该补充一点，“x”是我的协变量栅格堆栈（在本例中为 BioClim 层），“p”只是一个包含我的物种的 xy 坐标（按该顺序）的列表。

于 2016-02-17T18:02:12.367 回答
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以下列方式运行 R 中的最大值

maxent(predictors, parg, aarg)

在哪里

预测变量：环境变量堆栈

parg：存在地点的坐标（单独列中的 x 和 y 坐标）

aarg：背景点的坐标（单独列中的 x 和 y 坐标）

于 2016-02-15T03:55:55.653 回答