敬启者,
我通过 R 对二元选择任务的单个数据集(每个数据集包括几个试验,其中某个受试者需要选择选项 A 或 B)进行 MLE 分析。首先我尝试了优化(方法 = BFGS)。对于某些人,由于“非有限差分误差”,我无法获得参数估计值。我在网上搜索,发现bbmle工具箱可以通过在计算过程中提供“反转Hessian矩阵的选项”来处理这个错误。但是,即使我采用 mle2 函数并设置“skip.hessian=T”,错误仍然出现。我知道可能还有一些其他的独奏,比如改变最初的猜测;但是,有时更新后的初始猜测适用于该主题但不适用于其他主题,这真的很烦人。有人能告诉我如何在 mle2 中解决这个问题吗?我期待着您的回复。感谢,并有一个愉快的一天 :-)
最好的,杨
很抱歉没有提供测试数据,因为我没有在线驱动器。欢迎您通过电子邮件(huyang@uni-bonn.de)获取测试数据
我的代码如下:
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### Step 1: Define the Log-likelihood Function of M1 ###
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logl <- function(alpha,beta,delta1,delta2,delta3,epsilon){
data<-df_sbj
y <- data$Y
s1 <- data$s1
o1 <- data$o1
s2 <- data$s2
o2 <- data$o2
adv1<- ifelse(data$s1>data$o1,c(data$s1-data$o1),c(0))
adv2<- ifelse(data$s2>data$o2,c(data$s2-data$o2),c(0))
disadv1<- ifelse(data$o1>data$s1,c(data$o1-data$s1),c(0))
disadv2<- ifelse(data$o2>data$s2,c(data$o2-data$s2),c(0))
u1<-vector()
u2<-vector()
for (j in 1:nrow(data)) {
if (data$f1[j]=="human" & data$f2[j]=="greedy"){
u1[j]<-s1[j]-alpha*disadv1[j]-beta*adv1[j]+delta1*adv1[j]-delta1*disadv1[j]
u2[j]<-s2[j]-alpha*disadv2[j]-beta*adv2[j]+delta1*adv2[j]-delta1*disadv2[j]
} else if (data$f1[j]=="human" & data$f2[j]=="equal") {
u1[j]<-s1[j]-alpha*disadv1[j]-beta*adv1[j]-delta2*adv1[j]+delta2*disadv1[j]
u2[j]<-s2[j]-alpha*disadv2[j]-beta*adv2[j]-delta2*adv2[j]+delta2*disadv2[j]
} else if (data$f1[j]=="human" & data$f2[j]=="generous") {
u1[j]<-s1[j]-alpha*disadv1[j]-beta*adv1[j]-delta3*adv1[j]+delta3*disadv1[j]
u2[j]<-s2[j]-alpha*disadv2[j]-beta*adv2[j]-delta3*adv2[j]+delta3*disadv2[j]
} else {
u1[j]<-s1[j]-alpha*disadv1[j]-beta*adv1[j]
u2[j]<-s2[j]-alpha*disadv2[j]-beta*adv2[j]
}
}
#u1<-s1-alpha%*%disadv1-beta%*%adv1
#u2<-s2-alpha%*%disadv2-beta%*%adv2
udiff<-epsilon%*%(u2-u1)
# Use the log-likelihood of the Bernouilli distribution, where p is
# defined as the logistic transformation of a linear combination
# of predictors, according to logit(p)=(x%*%beta)
loglik <- sum(-y*log(1 + exp(-udiff)) - (1-y)*log(1 + exp(udiff)))
return(-loglik)
}
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### Step 2: Prepare the data ###
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df_sbj<-read.csv('./model/testdata_bbmle.csv',header=T)
fit <- mle2(logl, start = list(alpha = 0.2, beta=0.2, delta1=0.02, delta2=0.02, delta3=0.02, epsilon=0),method="BFGS",data=df_sbj,skip.hessian=T)