我对 C++ 很陌生,但我习惯于使用 R 语言进行一些编码。几周前,我开始组装一个小型应用程序,该应用程序应该复制和重命名文件对 (.seq/.ab1)。DNA 测序仪分析的结果(手动重命名数百个将是一种实时浪费,特别是因为我们有带有新名称的列表)。
一切似乎都很好,但是新文件(那些复制的)在它们的名称中出现了一个“特殊字符”(就在文件类型之前),它看起来像一个空格,但它不是(我已经用空格替换了它,并且文件正确打开)。删除它后,该文件可以由其关联的应用程序打开,但使用它,应用程序会指责该文件已损坏。
问题似乎来自与 ostringstream::str 成员函数相关的代码,但老实说我不知道如何解决它。在我附加文件类型之前,我想知道它是否没有在那里插入空字符......
这是负责的代码部分。它从 2 列 csv 文件中获取旧名称和新名称,数据以“;”分隔。原始数据和新的(重命名的文件)数据保存在不同的目录中,这就是我需要在 for 循环中为每个文件路径创建一个字符串的原因。我打算稍后检查新旧文件内容,可能使用 memcmp。但首先我需要正确重命名它们。
我在使用 gcc 4.8.4 作为编译器的 Ubuntu 14.04(64 位)机器上。我已经为可能糟糕的编码和糟糕的英语道歉,我不是母语人士(实际上是作家)。
fNew.open(filename);
std::ostringstream oldSeqName (std::ostringstream::ate);
std::ostringstream newSeqName (std::ostringstream::ate);
std::ostringstream oldAb1Name (std::ostringstream::ate);
std::ostringstream newAb1Name (std::ostringstream::ate);
std::fstream log;
time_t now = time(0);
for (std::string nOld, nNew; getline(fNew, nOld, ';') && getline(fNew, nNew); )
{
std::cout << "Old Name: " << nOld << " -> New Name: " << nNew << std::endl;
// Keep a log of the name changes
log.open("NameChangesLog.txt", std::fstream::out | std::fstream::app);
log << ctime(&now) << " - " << "Old Name: " << nOld << " -> New Name: " << nNew << std::endl;
log.close();
// Create old seq files paths string
oldSeqName.str(nOld);
oldSeqName << ".seq";
std::string osn = "./Seq/" + oldSeqName.str();
// Create new seq files paths string
newSeqName.str(nNew);
newSeqName << ".seq";
std::string nsn = "./renamed/" + newSeqName.str();
std::ifstream ifseq(osn, std::ios::binary);
std::ofstream ofseq(nsn, std::ios::binary);
ofseq << ifseq.rdbuf();
ifseq.close();
ofseq.close();
// Create old ab1 files paths string
oldAb1Name.str(nOld);
oldAb1Name << ".ab1";
std::string oan = "./Seq/" + oldAb1Name.str();
// Create new abq files paths string
newAb1Name.str(nNew);
newAb1Name << ".ab1";
std::string nan = "./renamed/" + newAb1Name.str();
std::ifstream ifab1(oan, std::ios::binary);
std::ofstream ofab1(nan, std::ios::binary);
ofab1 << ifab1.rdbuf();
ifab1.close();
ofab1.close();
}
fNew.close();