3

我正在尝试将“大”因素转换为 R 中的一组指标(即虚拟、二进制、标志)变量,如下所示:

FLN <- data.frame(nnet::class.ind(FinelineNumber))

哪里FinelineNumber是 Kaggle.com 当前沃尔玛竞赛的 5,000 级因子(如果您想重现此错误,数据是公开的)。

我不断收到这个令人担忧的警告:

In n * (unclass(cl) - 1L) : NAs produced by integer overflow

系统可用的内存基本上是无限的。我不确定问题是什么。

4

1 回答 1

6

的源代码nnet::class.ind是:

function (cl)     {
    n <- length(cl)
    cl <- as.factor(cl)
    x <- matrix(0, n, length(levels(cl)))
    x[(1L:n) + n * (unclass(cl) - 1L)] <- 1
    dimnames(x) <- list(names(cl), levels(cl))
    x
}

.Machine$integer.max是 2147483647。如果n*(nlevels - 1L)大于这个值,应该会产生你的错误。解决n

imax <- .Machine$integer.max
nlevels <- 5000
imax/(nlevels-1L)
## [1] 429582.6

如果您有 429583 或更多行(对于数据挖掘上下文而言不是特别大),您将遇到此问题。如上所述,如果您的建模框架可以处理稀疏矩阵,则使用(or ) 会做得更好。或者,您必须重写以避免此瓶颈(即按行和列而不是按绝对位置进行索引)[@joran 上面评论 R 通过双精度值索引大向量,因此您可能能够逃脱只是破解那条线Matrix::sparse.model.matrixMatrix::fac2sparseclass.ind

x[(1:n) + n * (unclass(cl) - 1)] <- 1

可能在as.numeric()此处或此处添加显式以强制强制加倍...]

即使你能够完成这一步,你最终也会得到一个 5000*650000 的矩阵——看起来这将是 12Gb。

 print(650*object.size(matrix(1L,5000,1000)),units="Gb")

我想如果你有 100Gb 的免费空间就可以了......

于 2015-12-18T20:23:03.050 回答