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我想编写一个宏/脚本来打开文件打开对话框，然后使用带有各种选项的 BF 导入所选图像。

我在这里找到了这个 JS 脚本来做后面的部分：

importClass(Packages.loci.plugins.BF);
importClass(Packages['loci.plugins.in.ImporterOptions']); // 'in' is a reserved word, hence the different syntax
importClass(Packages.loci.common.Region);

var path = "/path/to/file";
var options = new ImporterOptions();
options.setId(path);
options.setAutoscale(true);
options.setCrop(true);
options.setCropRegion(0, new Region(x, y, w. h));
options.setColorMode(ImporterOptions.COLOR_MODE_COMPOSITE);
var imps = BF.openImagePlus(options);

imps[0].show();

我还在这里找到了常规的宏语言文件打开对话框：

File.openDialog(title)

我如何在 JS 脚本中做这两件事？具体来说，如何在 JS 中创建文件打开对话框？

如果用宏 IJM 语言而不是 Javascript 更容易做到这两点，那么如何创建 BF 对象并设置导入选项？

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ImageJ 的所有宏功能都在 中实现ij.macro.Functions，所以你可以在 中找到你需要的东西Functions.java

  • 从Javascript中，您可以使用ij.io.OpenDialog：

    importClass(Packages.ij.io.OpenDialog);

od = OpenDialog("Choose a file", null);
folder = od.getDirectory();
file = od.getFileName();
path = folder + file;

  • 或者，您可以使用Bio-Formats Importer 宏命令的选项字符串，它都在您链接到的宏中：

    run("Bio-Formats Importer", "open=" + path + "autoscale color_mode=Default view=Hyperstack stack_order=XYCZT");

    要获得所需的选项，只需使用宏记录器。

于 2015-12-10T12:01:06.433 回答