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我正在尝试使用 scikit learn 实现决策树，然后使用 Graphviz 可视化决策树，我理解这是可视化 DT 的标准选择。我正在使用 PyCharm、anaconda、Python 2.7 和 OS X El Capitan。据我所知，我已经使用 PIP install 安装了 pydot 和 Graphviz，并且还直接在 Pycharm 中安装了它们，但无论我做什么，我都会不断得到一个“没有名为 graphviz 的模块”。

from sklearn.datasets import load_iris
from sklearn import tree
#import graphviz as gv
# uncommenting the row above produces an error
clf = tree.DecisionTreeClassifier()
iris = load_iris()
clf = clf.fit(iris.data, iris.target)
with open('graph.dot', 'w') as file:
    tree.export_graphviz(clf, out_file = file)
file.close()

目前运行此代码会生成 graph.dot 但我无法查看该文件。1. 如何让 graphviz 存储库工作？2. 如何将图表写入 PDF/PNG？我看到了一些例子，但没有工作 3. 我找到了这个命令： dot -Tps filename.dot -o outfile.ps 我在哪里使用它？以及如何验证我的 OS X 上是否存在 dot 实用程序？

提前致谢！

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您还可以使用以下代码导出为 pdf。

首先安装pydot2

pip install pydot2

然后您可以使用以下代码：

from sklearn.datasets import load_iris
from sklearn import tree
clf = tree.DecisionTreeClassifier()
iris = load_iris()
clf = clf.fit(iris.data, iris.target)

from sklearn.externals.six import StringIO
import pydot 

dot_data = StringIO() 
tree.export_graphviz(clf, out_file=dot_data) 
graph = pydot.graph_from_dot_data(dot_data.getvalue()) 
graph.write_pdf("graph.pdf")
于 2015-12-07T23:48:33.897 回答
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我很确定我使用自制软件安装了 graphviz，但看起来您也可以从http://www.graphviz.org/Download_macos.php下载二进制文件。如果你不能让 pydot 工作，你需要dot从终端运行命令，或者在你的脚本中使用子进程：

import subprocess
subprocess.call(['dot', '-Tpdf', 'tree.dot', '-o' 'tree.pdf'])
于 2015-12-07T22:18:05.127 回答
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如果您的系统上没有/想要graphviz，您还可以将.dot 文件作为文本打开并将内容复制到webgraphviz，然后它将为您创建和显示树。

但是，结果不是您可以保存的图片或文件，您必须为您创建的每棵树手动执行此操作。对于更复杂和/或批处理树构建，您需要系统上的实际graphviz，因此您可以dot从终端或直接从 Python 调用程序，如 maxymoo 所述。

于 2017-06-16T08:13:00.440 回答