我想使用包中的heatmap.2
函数创建一个热图gplots
。这是一个最小的例子。
require(gplots)
# create symmetric matrix
x = matrix(rnorm(100), nrow=10)
diag(x) <- 1
x[upper.tri(x)] <- t(x)[upper.tri(x)]
colnames(x) <- rownames(x) <- letters[1:nrow(x)]
# create side colours
varcols = setNames(rainbow(nrow(x)), rownames(x))
# create heatmap
heatmap.2(x,
symm = TRUE,
trace = "none",
revC=TRUE, # <-- THIS IS THE PROBLEM
ColSideColors = varcols,
RowSideColors = varcols
)
问题是sidecolors。x
是一个对称矩阵,因此列和行应该具有相同的侧色。只要revC = FALSE
. 但是,当我使用revC = TRUE
颜色的顺序时就搞砸了。有时 - 在小例子中 - 它有助于扭转ColSideColors
,但这并不总是有效。
我做错了什么还是这是一个gplots
错误?