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我最近才开始在运行 Yosemite 的 mac 上使用 Python 3.5，我正在尝试使用模块 networkx 来编译和生成图形/网络模型的一些视觉效果。我没有那么多的编程经验，所以如果我遗漏任何细节，我深表歉意。

我已经成功安装了 networkx（我能够使用其中的命令），但目前正在努力安装一个可促进绘图生成的可选模块：GraphViz。我尝试通过命令提示符运行 setup.py install 命令来安装 GraphViz，但 GraphViz 安装似乎需要另一个模块 PyDot（更具体地说是 PyDot2：pydot2-1.0.33-py3.5.egg.info）。这就是问题所在，因为我似乎无法让 PyDot 正常工作 - 在运行使用 PyDot 的 networkx 命令时，我不断收到以下错误（test2.py 是一个测试图形模型）：

Traceback (most recent call last):
  File "/Users/mainuser/Downloads/test2.py", line 6, in <module>
    nx.draw_graphviz(G)
  File "/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.5/lib/python3.5/site-packages/networkx/drawing/nx_pylab.py", line 982, in draw_graphviz
    pos = nx.drawing.graphviz_layout(G, prog)
  File "/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.5/lib/python3.5/site-packages/networkx/drawing/nx_pydot.py", line 257, in graphviz_layout
    return pydot_layout(G=G,prog=prog,root=root,**kwds)
  File "/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.5/lib/python3.5/site-packages/networkx/drawing/nx_pydot.py", line 277, in pydot_layout
    D=P.create_dot(prog=prog)
  File "/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.5/lib/python3.5/site-packages/pydot.py", line 1802, in <lambda>
    lambda f=frmt, prog=self.prog : self.create(format=f, prog=prog))
  File "/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.5/lib/python3.5/site-packages/pydot.py", line 1966, in create
    self.write(tmp_name)
  File "/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.5/lib/python3.5/site-packages/pydot.py", line 1895, in write
    dot_fd = file(path, "w+b")
NameError: name 'file' is not defined

在做了一些研究和玩耍之后，我觉得问题是我安装的 PyDot 版本与 Python 3.5 不兼容。但是，我不明白这是怎么回事，因为我安装了 PyDot2，它明确表示它与 Python 3+ 兼容。

任何见解或方向将不胜感激！

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我注意到了这个问题，并在 PyPi 上发布了 Python 3 兼容版本。原因是 pydot/pydot2 使用了 Python 3 中已经删除的功能。

对于 Python 3.x 的 Linux 系统，请尝试：

pip3 install pydot3

或者通常对于 Python 2.x，请尝试：

pip install pydot3

于 2016-01-25T05:32:43.527 回答