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我一直在努力将 numpy 和 scipy 升级/安装到我的 venv 下的最新版本。想要升级的原因是在venv下运行我的脚本时出错：

(venv)[malapradej@lotus Code]$ python2.7 create_emulator_ap_680-755.py --sza 80 --vza 80 --raa 180 --train /work/scratch/malapradej/DASF/Data/LUT_ap/lhd250_train_ap1 --validate /work/scratch/malapradej/DASF/Data/LUT_ap/lhd300_valid_ap1 --plot n

RuntimeError: module compiled against API version 9 but this version of numpy is 7
Traceback (most recent call last):
  File "./create_emulator_ap_680-755.py", line 57, in <module>
    import gp_emulator
  File "/home/users/malapradej/venv/lib/python2.7/site-packages /gp_emulator/__init__.py", line 3, in <module>
    from multivariate_gp import MultivariateEmulator
  File "/home/users/malapradej/venv/lib/python2.7/site-packages/gp_emulator/multivariate_gp.py", line 32, in <module>
    import h5py
  File "/home/users/malapradej/venv/lib/python2.7/site-packages/h5py/__init__.py", line 23, in <module>
    from . import _conv
  File "h5py/h5t.pxd", line 14, in init h5py._conv (/tmp/pip-build-JA5F4M/h5py/h5py/_conv.c:6970)
  File "h5py/h5t.pyx", line 1, in init h5py.h5t (/tmp/pip-build-JA5F4M/h5py/h5py/h5t.c:19707)
ImportError: numpy.core.multiarray failed to import

在 venv 下我跑了：

pip install -Iv numpy==1.10.1

和

pip install -Iv --upgrade numpy==1.10.1

每次都以：

Successfully installed numpy-1.7.0
Cleaning up...

当我使用 yolk 查看使用了哪些包时：

yolk -l | grep numpy

numpy           - 1.10.1       - non-active
numpy           - 1.7.0        - active development (/usr/lib/python2.7/site-packages)
numpy           - 1.9.2        - non-active

我似乎已经下载了该软件包，但不会升级和激活它。

如果我运行 ipython 它似乎可以工作：

In [1]: import numpy as np

In [2]: print np.__version__
1.10.1

但是在python2.7下它显示的是早期版本：

(venv)[malapradej@cems-sci1 venv]$ python2.7

>>> import numpy as np
>>> np.__version__
'1.7.0'

scipy 也是如此。

非常感谢帮助，

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1 回答 1

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我唯一的选择是删除旧的 virtualenv 并重新安装 usingvirtualenv --system-site-packages ~/venv 和所有软件包再次使用pip install --upgrade <package>. 似乎 venv 在某个地方被损坏了，试图找出发生这种情况的地方需要太长时间。

于 2015-12-02T14:45:23.340 回答