r - R 系统函数总是返回错误 127

Question

我需要执行外部工具R并处理该工具中发生的错误（如果有）。我知道 3 个函数可以做一些熟悉我的任务的事情：

shell, system and system2.

试图测试那些，我看到了那个命令

shell("notepad")

打开记事本。据我所知，shell 不允许检查错误（没有可查看的界面stderr）。

当我打电话

system("notepad")

或者

system2("notepad")

R冻结尝试发出这些命令。

打电话

system("start notepad")

或者

system2("start notepad")

返回警告

Warning message:
running command '"start notepad"' had status 127

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改编@DavidTseng的答案（抱歉没有足够的声誉来支持它）......

system("cmd.exe", input = "notepad")

在 Windows 中为我工作。

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正如我在评论中提到的，R 文档显示，在 Windows 中，该system()函数不会启动单独的 shell（如果需要）。这就是为什么命令行命令使用运行system()，但需要单独窗口的记事本不运行的原因：

从文档中system()：

最重要的区别是在类 Unix 系统上启动一个 shell，然后运行命令。在 Windows 上，命令直接运行——使用 shell 作为通过 shell 运行命令的接口（默认情况下是 Windows shell cmd.exe，它与 POSIX shell 有很多不同）。

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4

system("bash -l", input = "notepad")

于 2016-11-09T12:59:48.903 回答

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我不确定 R 的更新是否允许这样做，因为这个问题是在将近四年前被问到的，但system("\"C:\path\to\exe.exe\" args", intern = T)对我有用，并且会打开一个单独的子窗口并在 Windows 10 + R 3.6 + RStudio 上工作。

不使用'intern = T'给了我一个返回码127并且没有运行这个过程。

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我遇到过同样的问题。安装过程中还有一个我没有做的额外步骤。

参考网址

writeLines('PATH="${RTOOLS40_HOME}\usr\bin;${PATH}"', con = "~/.Renviron")

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对于 Windows 用户错误：system(path("c:", "program files", "r", "anysoft.EXE")) 但有效：system(path("c:", shQuote("program files"), "r", "anysoft.EXE"))

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你们把事情弄得这么复杂。我通过参考这个答案解决了这个问题。问题出在 PATH 上。输入Sys.which('')R，你什么也看不到。所以你必须在 CMD 中设置路径，然后Sys.setenv(PATH = '')在 R 中使用才能完成这项工作。