r-caret - 特征选择

Question

我试图从一个表达式中找到一个有用的特征选择方法，该方法对一组 20000 个基因进行，set(microarray)以获得一个仅包含有用基因的模型。我尝试使用插入符号中的 RFE，但我得到了一个 stackOverflow，因为后向选择不支持 where 的数据n(predictors) > n(samples)。任何人都可以提出一个合理的方法，或者这种 RFE 选择方法的解决方案吗？

提前致谢。

Answer 1

您是否尝试使用遗传算法进行特征选择？有不同的软件包可以做到这一点 - GA、gena​​lg、caret（在 R 中）。

看看这个博客，已经用例子解释了使用遗传算法的特征选择 - http://topepo.github.io/caret/GA.html

希望能帮助到你。