scaffold - 与实际染色体相比，未放置的基因组支架是独一无二的吗？

Question

我使用 UCSC blat 搜索马基因组序列。返回了三个结果，两个是未放置的scaffold，另一个是chr1。所有人都对我的查询具有 100% 的身份（gagttcctagacaccaaatacaacgtgggaatacacaacctactggcctatgtgaaacacctgaaaggccagaatgaggaagccctgaagagcttgagagaagctgaagacttaatccaggaagaacatggtgaccaatcaggcat）。我的问题是，马体内是否有这个基因的 3 个拷贝，或者支架可以属于 chr1 吗？不管怎么说，老鼠身上只有一个基因拷贝。

Answer 1

答案是所有 3 个结果都是基因组中的独特位置。未放置的支架是基因组中正在处理但尚未添加到参考基因组中的序列。