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我有一个超过 500 万行和 20 个字段的文件。我想在 Pandas 中打开它,但出现内存不足错误:

pandas.parser.CParserError: Error tokenizing data. C error: out of memory

然后,我阅读了一些关于类似问题的帖子并发现了 Blaze,但遵循三种方法(.Data、.CSV、.Table),显然没有一个有效。

# coding=utf-8
import pandas as pd
from pandas import DataFrame, Series
import re
import numpy as np
import sys
import blaze as bz
reload(sys)
sys.setdefaultencoding('utf-8')

# Gave an out of memory error
'''data = pd.read_csv('file.csv', header=0, encoding='utf-8', low_memory=False)
df = DataFrame(data)

print df.shape
print df.head'''

data = bz.Data('file.csv')

# Tried the followings too, but no luck
'''data = bz.CSV('file.csv')
data = bz.Table('file.csv')'''

print data
print data.head(5)

输出:

_1
_1.head(5)
[Finished in 1.0s]
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1 回答 1

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火焰

对于bz.Data(...)对象,您必须实际执行某些操作才能获得结果。它根据需要加载数据。如果您在终端并输入

>>> data

你会得到头部repr-ed到屏幕上。如果您需要使用打印功能,请尝试

bz.compute(data.head(5))

dask.dataframe

您也可以考虑使用dask.dataframe,它具有与 pandas 类似(尽管是子集)的 API

>>> import dask.dataframe as dd
>>> data = dd.read_csv('file.csv', header=0, encoding='utf-8')
于 2015-10-15T14:30:38.587 回答