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SO：Linux Ubuntu 14.04 LTS R：R 版本 3.2.1 (2015-06-18) --“世界著名宇航员”版权所有 (C) 2015 统计计算平台 R 基金会：i686-pc-linux-gnu (32 -少量）

当我尝试安装包rjags时，我收到以下致命错误：

install.packages("rjags")
Installing package into ‘/home/marco/.rkward/library’
(as ‘lib’ is unspecified)
--- Please select a CRAN mirror for use in this session ---
trying URL 'http://mirrors.softliste.de/cran/src/contrib/rjags_3-15.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 66879 bytes (65 KB)
==================================================
downloaded 65 KB

* installing *source* package ‘rjags’ ...
** package ‘rjags’ successfully unpacked and MD5 sums checked
checking for prefix by checking for jags... no
configure: error: "Location of JAGS headers not defined. Use configure arg '--with-jags-include' or environment variable 'JAGS_INCLUDE'"
ERROR: configuration failed for package ‘rjags’
* removing ‘/home/marco/.rkward/library/rjags’

The downloaded source packages are in
    ‘/tmp/RtmpditLat/downloaded_packages’
Warning message:
In install.packages("rjags") :
  installation of package ‘rjags’ had non-zero exit status

显然，第一条错误消息是

配置：错误：“未定义 JAGS 标头的位置。使用配置参数 '--with-jags-include' 或环境变量 'JAGS_INCLUDE'”

我该如何解决这个问题？

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3 回答 3

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正如顶级评论所解释的，您需要在系统中安装 JAGS（Just Another Gibbs Sampler）。由于您使用的是 Ubuntu 14.04，因此运行

sudo apt-get install jags

应该足够了。但是，如果您在另一个发行版中（或者，由于某种原因，上面的代码对您不起作用），最好了解如何从源代码获取 JAGS：

  1. 访问http://mcmc-jags.sourceforge.net/
  2. 在“下载”下查找正确的版本。例如，Fedora 用户应该查看http://download.opensuse.org/repositories/home:/cornell_vrdc/的 Fedora_20 文件夹
  3. 不要忘记下载基础版和开发版。

安装成功后，你可以回到R（无论如何它可以在整个过程中保持打开状态）并安装你想要的包。

于 2016-07-12T09:28:22.760 回答
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对我来说，首先，我通过终端使用安装锯齿：

sudo apt-get install jags

接着

install.packages("rjags")

并且错误消失了。

于 2016-11-23T16:47:46.483 回答
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1) 如有必要，下载并安装 R ( https://www.r-project.org/ ) 和可能的 R 用户界面，如 R Studio（有关 R 入门的提示，请参见此处）。2) 根据操作系统要求下载并安装 JAGS。( http://mcmc-jags.sourceforge.net/ ) 3) 安装额外的 R 包：例如，在 R install.packages("rjags") 中。特别是，我使用包 rjags 与 JAGS 和 coda 接口来处理 MCMC 输出。

于 2020-02-22T16:51:15.760 回答