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在终端中安装 matlab python 包后，使用：

cd "matlabroot\extern\engines\python"
python setup.py install

并试图运行它，我得到一个段错误：

:~$ python
Python 2.7.10 |Anaconda 2.3.0 (x86_64)| (default, May 28 2015, 17:04:42) 
[GCC 4.2.1 (Apple Inc. build 5577)] on darwin
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
Anaconda is brought to you by Continuum Analytics.
Please check out: http://continuum.io/thanks and https://binstar.org
>>> import matlab.engine
Segmentation fault: 11

但是，我可以通过设置 DYLD_LIBRARY_PATH 来解决这个问题，之后 matlab.engine 工作：

:~$ export DYLD_LIBRARY_PATH=/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/Current/lib:$DYLD_LIBRARY_PATH
:~$ python
Python 2.7.6 (default, Sep  9 2014, 15:04:36) 
[GCC 4.2.1 Compatible Apple LLVM 6.0 (clang-600.0.39)] on darwin
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> import matlab.engine
>>> eng = matlab.engine.start_matlab()
>>> exit()

但是，当我之后尝试启动 iPython 时，出现此错误：

Traceback (most recent call last):
  File "//anaconda/bin/ipython", line 4, in <module>
    from IPython import start_ipython
  File "//anaconda/lib/python2.7/site-packages/IPython/__init__.py", line 45, in <module>
    from .config.loader import Config
  File "//anaconda/lib/python2.7/site-packages/IPython/config/__init__.py", line 6, in <module>
    from .application import *
  File "//anaconda/lib/python2.7/site-packages/IPython/config/application.py", line 19, in <module>
    from IPython.config.configurable import SingletonConfigurable
  File "//anaconda/lib/python2.7/site-packages/IPython/config/configurable.py", line 12, in <module>
    from .loader import Config, LazyConfigValue
  File "//anaconda/lib/python2.7/site-packages/IPython/config/loader.py", line 16, in <module>
    from IPython.utils.path import filefind, get_ipython_dir
  File "//anaconda/lib/python2.7/site-packages/IPython/utils/path.py", line 14, in <module>
    import tempfile
  File "//anaconda/lib/python2.7/tempfile.py", line 32, in <module>
    import io as _io
  File "//anaconda/lib/python2.7/io.py", line 51, in <module>
    import _io
ImportError: dlopen(//anaconda/lib/python2.7/lib-dynload/_io.so, 2): Symbol not found: __PyErr_ReplaceException
  Referenced from: //anaconda/lib/python2.7/lib-dynload/_io.so
  Expected in: dynamic lookup

如您所见，python 版本不同。我认为这是我的系统 Python 和 Anaconda 之间的冲突，但我不确定如何解决它，非常感谢任何帮助。谢谢。

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3 回答 3

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在我的情况下，将东西添加到 LD_LIBRARY_PATH（Ubuntu 的 DYLD_LIBRARY_PATH 版本）只会让事情变得更糟。相反，我必须确保它没有引用 Python 安装，并且必须从 /usr/lib 添加一个符号链接。见https://stackoverflow.com/a/45161288/2524427

于 2017-07-18T08:42:39.260 回答
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您需要使用 conda 命令行安装实用程序安装库，而不是 python。应该让你去conda help search。conda help install

于 2015-08-09T21:15:11.597 回答
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这不是一个直接的解决方案，但我遇到了同样的问题并使用了这个解决方法。我应该说我终于matlab.engine在我的 Python 环境中运行了，但它简直糟透了。它无法在其他文件夹中运行带有嵌入脚本的脚本，并且我也遇到过它找不到一些内置函数。以下是为 Unix 机器实现的，但我相信它不需要太多修改就可以在 Windows 中工作。

这是我所做的：

  1. 编写了一个主要的 Matlab 脚本，它可以完成我在 Matlab 中需要的一切。
  2. 通过Python中的子进程运行该脚本。

就我而言，我需要对矩阵X执行一系列矩阵运算并返回矩阵S。矩阵运算需要使用特定的 Matlab 函数。我的第一个想法是打开一个 Matlab 会话，matlab.engine然后在 Python 中管理矩阵运算，只在需要时调用 Matlab 函数。相反（如项目符号所述）我编写了一个 Matlab 函数ComputeSimilarityMat，该函数接受X，执行所有必要的操作，并返回S。然后我基本上只是使用子进程从 Python 运行了那个 Matlab 函数。

这就是通过子进程管理 Matlab 脚本的 Python 脚本的样子：

import subprocess
import numpy as np

def run_matlab(X):
    """Produce trait-similarity matrix S from a trait-space matrix X

    Parameters
    ----------
    X : numpy.ndarray

    Returns
    -------
    S : numpy.ndarray
    """

    # Dump input in .csv, so Matlab can load it
    np.savetxt('X.csv', X, delimiter=",")

    # Code executed in Matlab. Important to end with quit;
    matlab_code = "X=csvread('X.csv');" \
                  "S=ComputeSimilarityMat(X);" \
                  "csvwrite('S.csv',S);" \
                  "quit;"

    # -nosplash suppresses the splash window on startup
    matlab_call = ["matlab", "-nodesktop", "-nosplash", "-r", matlab_code]
    subprocess.call(matlab_call)

    # Load the .csv file that Matlab dumps after finishing
    S = np.genfromtxt('X.csv', delimiter=",")

    return S

我不得不说，我确信有一种更好的方法可以将对象传递给 Matlab，然后必须像这样保存和加载，但它对我有用。虽然仍然希望有所改善matlab.engine，但在此之前我会采用这种方法。

注意：要从命令行/子进程运行 Matlab，您需要将 Matlab bin 文件夹添加到 PATH 变量中，如下所示：

export PATH="/Applications/MATLAB_R2015a.app/bin:$PATH"

我只是把它放在我的 .profile 文件中。

于 2016-02-18T13:57:33.953 回答