java - 使用ELKI源码进行层次聚类

Question

我尝试使用 ELKI（用于开发由索引结构支持的 KDD 应用程序的环境）进行层次聚类。所以前几天，我导入了 ELKI 源代码（Maven 项目），然后我运行了 miniGUI。

我的问题是：

1. 我想使用 ResultVisulizer 作为结果。但是，我发现 resulthandler 中没有 ResultVisulizer 项。我应该怎么做才能使这个 ResultVisulizer 项目在此处列出？

2. 我想看看层次聚类的树状图。为此需要在这个 miniGUI 中设置哪些参数？

Answer 1

1. 要启用 SVG 可视化工具，请启用svgmaven配置文件。SVG 添加了大约 17 MB 的依赖项，因此我们决定将其设为可选模块。

2. 目前ELKI中没有树状图可视化，因为这样的可视化不是很可扩展；如果有几十个实例，它们就会变得难以阅读。此外，在许多有趣的数据集上，距离（高度）太相似了，不幸的是，树状图也不是很有用。

   如果您提取集群并简化层次结构，ELKI 将显示集群层次结构树，但不会使用高度信息（出于上述原因，以及出于可读性原因）。ELKI 具有强大的从层次聚类中提取聚类的方法，这些方法在 R 中不可用。

   欢迎您贡献树状图可视化；但请尽量使其对广泛的用户群有用，而无需过多的定制。

这是来自 R （来源）的一个示例，说明了为什么我不相信树状图（以及为什么它在我的个人优先级列表中很低 - 其他人必须将其贡献给 ELKI）：