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有没有一种方便的方法可以从 gam 图中提取数据,而无需实际绘制 gam 对象?

这是一个虚拟示例。 plot.data里面有我想要的数据,但我不希望绘图窗口受到影响。

library(mgcv)    
x=1:10000/1000
y = sin(x)+rnorm(10000,sd=2)
m = gam(y~s(x))
plot.data<-plot(m,plot=F)
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它看起来plot.gam没有不绘图的选项。但是你可以试试

plot.data <- {
    dev.new()
    res <- plot(m)
    dev.off()
    res
}

或者可能

plot.data <- {
    pdf(NULL)
    res <- plot(m)
    invisible(dev.off())
    res
}
于 2015-08-06T19:08:01.787 回答
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如果您gam()从包中使用gam,则可以通过调用以列表形式获取这些数据preplot(m)。这是您的数据的样子:

library(gam)
x = 1:10000/1000
y = sin(x)+rnorm(10000,sd=2)
m = gam(y~s(x))
preplot(m)

List of 1
 $ s(x):List of 5
  ..$ x   : num [1:10000] 0.001 0.002 0.003 0.004 0.005 0.006 0.007 0.008 0.009 0.01 ...
  ..$ y   : Named num [1:10000] 0.421 0.421 0.421 0.421 0.421 ...
  .. ..- attr(*, "names")= chr [1:10000] "1" "2" "3" "4" ...
  ..$ se.y: Named num [1:10000] 0.0783 0.0782 0.0781 0.0781 0.078 ...
  .. ..- attr(*, "names")= chr [1:10000] "1" "2" "3" "4" ...
  ..$ xlab: chr "x"
  ..$ ylab: chr "s(x)"
  ..- attr(*, "class")= chr "preplot.gam"
 - attr(*, "class")= chr "preplot.gam"

该列表的xy组件是我认为您所追求的。据推测,如果您的模型中有多个平滑项,则preplot列表的第 i 个组件将对应于您最初调用gam().

于 2015-08-06T19:07:39.950 回答