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我要做的是在来自 MICE 的 5 个估算数据集上拟合 5 个 Kaplan Meier 曲线。我的目标是在每个时间点取 5 个生存概率的平均值。我认为如果我有构成每条 KM 曲线的阶跃函数的确切形式,这将很容易,但我不知道如何提取它。

这是我将运行的代码示例

#make up data
 survival_time=rexp(10,3)
 dead=sample(c(0,1),10,replace=TRUE)
 gender=sample(c(0,1),10,replace=TRUE)

 #induce missingness in gender
 gender[3:5]=NA
 data=cbind(survival_time,dead,gender)

 #do imputation
 imp=mice(data)

 #fit KM curves on each of the imputed datasets
 km_fit=with(imp,survfit(Surv(survival_time,dead)~gender))

 #now break down each km curve into male and female
 #and average the surv prob at each time
 #but how?

挑战在于生存时间和死亡指标始终是固定的,但每个性别的数量在插补之间会发生变化。正因为如此,每组中的数量,因此事件的数量和时间在插补之间发生变化。

我的计划是什么,假设我可以得到阶跃函数,那就是在阶跃函数上使用 apply predict 来获得手段。这是最好的解决方案,还是您认为会有更好的解决方案?

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为了在评论中记录答案,这是通过使用summary (km_fit) withtimes参数来解决的。

于 2015-08-04T21:13:58.973 回答