r - 叠加不同的物种积累图

Question

我想在 R 中绘制一些物种积累曲线，这些曲线可以以灰度格式相互叠加，同时易于解释。这是我想要输出的绘图类型的链接，多边形具有不同类型的灰色和一定程度的透明度，线条具有不同的lty值。一些示例数据：

df1 <- as.data.frame(matrix(sample(0:1, 3*10, replace=TRUE), ncol=3))
df2 <- as.data.frame(matrix(sample(0:2, 4*10, replace=TRUE), ncol=4))
library(vegan)
spec1 <- specaccum(df1)
spec2 <- specaccum(df2)

这是迄今为止我所获得的plot（不是很好的示例数据，但基本原理是正确的）：

plot(spec2, ci.type = "polygon", ci.lty = 0, ci.col = "grey")
plot(spec1, ci.type = "polygon", ci.lty = 0, ci.col = "gray50",add= TRUE)

当我尝试改变lty时，它说：

多边形中的错误（c（xaxvar，rev（xaxvar）），c（x$richness - ci * x$sd，rev（x$richness +）：由多个实际参数匹配的形式参数“lty”。

我不知道如何克服这一点。任何帮助将不胜感激。

Answer 1

使用您的数据，您需要将ci.col参数更改为具有透明度值的rgb()颜色规范（有关详细信息，请参见此处， -请记住，根据文档，可能并非所有设备都支持透明度）：alpha

plot(spec2, ci.type = "polygon", ci.lty = 0, ci.col = rgb(0, 0, 0, 0.5))
plot(spec1, ci.type = "polygon", ci.lty = 1, ci.col = rgb(.5, .5, .5, 0.5),add= TRUE).

这将为您提供以下情节：