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我是R的新手,所以请耐心等待。

我有一个物种的 4 个种群(在 1 列中流行),具有不同的样本大小。已经分析了每个个体(每一行)的 mitDNA 单倍型(在另一列中)我现在需要标准化所有种群的样本大小并估计 FST . 我想这可以简单地通过一些重复的重采样方法来完成,以便在总体中获得随机子样本,但我不确定什么是正确的方法。

另外,我从来没有在 R 中估计过 Fst。有没有办法在类似于下面的表格中获得输出?或者直接将二次采样的结果应用到 R 中的一个包中,可以在这个过程之后估计 Fst?

df <- read.table(text="pop  hap
1   A
1   A
1   B
1   B
1   B
1   C
1   D
2   F
2   F
2   A
2   A
2   B
2   E
3   A
3   A
3   B
3   D
4   A
4   A
4   A
4   B
4   B", header=TRUE)

希望我说清楚了。

非常感谢,提前。

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