我是R的新手,所以请耐心等待。
我有一个物种的 4 个种群(在 1 列中流行),具有不同的样本大小。已经分析了每个个体(每一行)的 mitDNA 单倍型(在另一列中)我现在需要标准化所有种群的样本大小并估计 FST . 我想这可以简单地通过一些重复的重采样方法来完成,以便在总体中获得随机子样本,但我不确定什么是正确的方法。
另外,我从来没有在 R 中估计过 Fst。有没有办法在类似于下面的表格中获得输出?或者直接将二次采样的结果应用到 R 中的一个包中,可以在这个过程之后估计 Fst?
df <- read.table(text="pop hap
1 A
1 A
1 B
1 B
1 B
1 C
1 D
2 F
2 F
2 A
2 A
2 B
2 E
3 A
3 A
3 B
3 D
4 A
4 A
4 A
4 B
4 B", header=TRUE)
希望我说清楚了。
非常感谢,提前。