python - 将networkx图保存到json图的方法？

Question

似乎networkx中应该有一个方法来导出json图形格式，但我没有看到它。我想这应该很容易用 nx.to_dict_of_dicts() 完成，但需要一些操作。有人知道一个简单而优雅的解决方案吗？

Answer 1

本文档包含完整说明

一个简单的例子是这样的：

import networkx as nx
from networkx.readwrite import json_graph

DG = nx.DiGraph()
DG.add_edge('a', 'b')
print json_graph.dumps(DG)

您还可以查看Javascript/SVG/D3很好的示例，将物理添加到图形可视化中。

Answer 2

通常我使用以下代码：

import networkx as nx; 
from networkx.readwrite import json_graph;
G = nx.Graph();
G.add_node(...)
G.add_edge(...)
....
json_graph.node_link_data(G)

除了关于图的其他信息（方向性，......等）之外，它将创建 json 格式的图，其中节点位于nodes和边缘links

Answer 3

这是我刚刚使用的 JSON 方法，以及用于读取结果的代码。它会保存节点和边缘属性，以备不时之需。

import simplejson as json
import networkx as nx
G = nx.DiGraph()
# add nodes, edges, etc to G ...

def save(G, fname):
    json.dump(dict(nodes=[[n, G.node[n]] for n in G.nodes()],
                   edges=[[u, v, G.edge[u][v]] for u,v in G.edges()]),
              open(fname, 'w'), indent=2)

def load(fname):
    G = nx.DiGraph()
    d = json.load(open(fname))
    G.add_nodes_from(d['nodes'])
    G.add_edges_from(d['edges'])
    return G

Answer 4

其余的解决方案对我不起作用。从networkx 2.2 文档中：

nx.write_gpickle(G, "test.gpickle")
G = nx.read_gpickle("test.gpickle")

Answer 5

尝试这个：

# Save graph
nx.write_gml(G, "path_where_graph_should_be_saved.gml")

# Read graph
G = nx.read_gml('path_to_graph_graph.gml')

Answer 6

节点和边是否有足够的信息？如果是这样，您可以编写自己的函数：

json.dumps(dict(nodes=graph.nodes(), edges=graph.edges()))