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我刚刚为甲基化 450k 分析安装了 ChAMP 及其所有依赖项。

我正在尝试本教程(http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/ChAMP/inst/doc/ChAMP.pdf)但出现错误。

运行 Probe Lasso DMR Hunter 时,我遇到“您发现 4161 个重要的 MVP,其 BH 调整后的 P 值低于 0.05 错误[.data.frame(dmr.beta.means, , 22:24, ) : undefined columns selected"

该错误会阻止分析停止,并且我无法复制上述教程中显示的内容。

我已经尝试卸载并重新安装 ChAMP,但无济于事...

任何建议和见解将不胜感激!提前致谢!

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使用R 3.1.0,错误可以解决。

于 2015-07-20T04:46:54.393 回答