我有一个大的 fastq 文件，我想将序列“TTAAGG”添加到我文件中每个序列的末尾（第 2 行，然后每 4 行之后），同时仍保持 fastq 文件格式。例如：这是我开始的第一行：
@HWI-D00449:41:C2H8BACXX:5:1101:1219:2053 1:N:0:
GCAATATCCTTCAACTA
+
FFFHFHGFHAGGIIIII
我希望它打印出来：
@HWI-D00449:41:C2H8BACXX:5:1101:1219:2053 1:N:0:
GCAATATCCTTCAACTATTAAGG
+
FFFHFHGFHAGGIIIII
我想 sed 或 awk 会对此有好处，但我一直无法找到允许我保持 fastq 格式的解决方案。
我试过了：
awk 'NR%4==2 { print $0 "TTAAGG"}' < file_in.fastq > fileout_fastq
它将 TTAAGG 添加到第二行，然后每隔四行添加一次，但它也删除了其他三行。
有没有人有我可以使用的命令行的建议，或者如果你知道当前可用的包可以做到这一点，请告诉我！