linux - LAMMPS 用于 GPU 错误 - /usr/bin/ld: 在使用 make 命令制作时找不到 -lmpi_stubs

Question

我正在尝试在 gpu 中安装 LAMMPS。按照http://lammps.sandia.gov/doc/accelerate_gpu.html中给出的步骤后，我完成了步骤 (a) 并获得了文件 - libgpu.a 和 Makefile.lammps。

当我尝试继续第二步（在 make yes-gpu 之后进行串行）时，我收到一条错误消息 - /usr/bin/ld: cannot find -lmpi_stubs。

Answer 1

该错误消息表明链接器无法找到构建所需的 MPI 库。通常，make serial构建没有 MPI 支持的灯。从make help（在lammps/src目录中调用）：

# serial = RedHat Linux box, g++4, no MPI, no FFTs

但是，Lammps GPU 包需要 MPI。因此，

1. 确保您已安装必要的 MPI 库。
2. 使用以下命令之一构建 lammps（make help有关更多选项，请参阅 ）：
   1. make g++（编译器：g++4，MPI 实现：MPICH2）
   2. make g++3（编译器：g++3，MPI 实现：MPICH2）
   3. make linux（编译器：icc，MPI 实现：MPICH2）
   4. make openmpi（编译器：mpic++，MPI 实现：OpenMPI-1.1）