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我遇到了一个非常令人沮丧的指针问题。我之前在这里发布过： TOUGH：在 C++ 中处理深度嵌套的指针

但是那个帖子太长了而且过时了，所以我选择重新发布更多细节。

这是定义我的类型的头文件：

#include <string>
#include <vector>
#include <sstream>
#include <iostream>

#define USE_3D_GEOM
//#define USE_2D GEOM

#define DEBUG

#ifdef USE_3D_GEOM
 #define DIMENSIONS 3
#elif USE_2D_GEOM
 #define DIMENSIONS 2
#else
 #define DIMENSIONS 1
#endif

#ifndef _COMMON_H
#define _COMMON_H

template<class T>
inline T from_string(const std::string& s)
{
     std::istringstream stream (s);
     T t;
     stream >> t;
     return t;
};

template <class T>
inline std::string to_string (const T& t)
{
std::stringstream ss;
ss << t;
return ss.str();
}

enum e_ensemble_kind 
{
  MICROCANONICAL,
  CANONICAL,
  NVT,
  GRAND_CANONICAL,
  NPT,
  NVE
};

enum e_potential_kind 
{
  HARD_SPHERE,
  SQUARE_WELL,
  LENNARD_JONES
};

enum e_file_types
{
  MC_SIMPLE,
  NAMD,
  GROMACS,
  CHARMM
};

#ifdef USE_3D_GEOM
typedef struct s_coordinates t_coordinates;
#endif

#ifdef USE_2D_GEOM
typedef struct s_coordinates t_coordinates;
#endif

typedef struct s_particle t_particle;

typedef struct s_bond t_bond;

typedef struct s_angle t_angle;


typedef struct s_dihedral t_dihedral;

typedef struct s_molecule t_molecule;

typedef struct s_lj_param t_lj_param;

typedef struct s_bond_param t_bond_param;

typedef struct s_angle_param t_angle_param;

typedef struct s_dih_param t_dih_param;

typedef struct s_lookup_tab t_lookup_tab;

#ifdef USE_3D_GEOM
struct s_coordinates
{
  double x;
  double y;
  double z;

  s_coordinates& operator+(const s_coordinates &to_add)
  {
    x += to_add.x;
    y += to_add.y;
    z += to_add.z;
    return *this;
  }
  s_coordinates& operator-(const s_coordinates &to_subtract)
  {
    x -= to_subtract.x;
    y -= to_subtract.y;
    z -= to_subtract.z;
    return *this;
  }
  s_coordinates& operator=(const s_coordinates &to_assign)
  {
    x = to_assign.x;
    y = to_assign.y;
    z = to_assign.z;
    return *this;
  }
  bool operator==(const s_coordinates &to_assign)
  {

    return x == to_assign.x && y == to_assign.y && z == to_assign.z;
  }
};
#endif

#ifdef USE_2D_GEOM
struct s_coordinates
{
  double x;
  double y;

  s_coordinates& operator+(const s_coordinates &to_add)
  {
    x += to_add.x;
    y += to_add.y;
    return *this;
  }
  s_coordinates& operator-(const s_coordinates &to_subtract)
  {
    x -= to_subtract.x;
    y -= to_subtract.y;
    return *this;
  }
  s_coordinates& operator=(const s_coordinates &to_assign)
  {
    x = to_assign.x;
    y = to_assign.y;
    return *this;
  }
  bool operator==(const s_coordinates &to_assign)
  {

    return x == to_assign.x && y == to_assign.y;
  }
};
#endif

typedef struct s_particle
{
  t_coordinates position;
  double charge;
  double mass;
  std::string name;
  std::vector<t_lj_param>::iterator my_particle_kind_iter;

  s_particle& operator=(const s_particle &to_assign)
  {
    position = to_assign.position;
    charge = to_assign.charge;
    mass = to_assign.mass;
    name = to_assign.name;
    my_particle_kind_iter = to_assign.my_particle_kind_iter;
    return *this;
  }
} t_particle;

struct s_bond
{
  t_particle * particle_1;
  t_particle * particle_2;
  std::vector<t_bond_param>::iterator my_bond_kind_iter;

  s_bond& operator=(const s_bond &to_assign)
  {
    particle_1 = to_assign.particle_1;
    particle_2 = to_assign.particle_2;
    my_bond_kind_iter = to_assign.my_bond_kind_iter;
    return *this;
  }
};

struct s_angle
{
  t_particle * particle_1;
  t_particle * particle_2;
  t_particle * particle_3;
  std::vector<t_angle_param>::iterator my_angle_kind_iter;

  s_angle& operator=(const s_angle &to_assign)
  {
    particle_1 = to_assign.particle_1;
    particle_2 = to_assign.particle_2;
    particle_3 = to_assign.particle_3;
    my_angle_kind_iter = to_assign.my_angle_kind_iter;
    return *this;
  }
};


struct s_dihedral
{
  t_particle * particle_1;
  t_particle * particle_2;
  t_particle * particle_3;
  t_particle * particle_4;
  std::vector<t_dih_param>::iterator my_dih_kind_iter;

  s_dihedral& operator=(const s_dihedral &to_assign)
  {
    particle_1 = to_assign.particle_1;
    particle_2 = to_assign.particle_2;
    particle_3 = to_assign.particle_3;
    particle_4 = to_assign.particle_4;
    my_dih_kind_iter = to_assign.my_dih_kind_iter;
    return *this;
  }
};

struct s_molecule
{
  std::string res_name;
  std::vector<t_particle> my_particles;
  std::vector<t_bond> my_bonds;
  std::vector<t_angle> my_angles;
  std::vector<t_dihedral> my_dihedrals;

  s_molecule& operator=(const s_molecule &to_assign)
  {
    res_name = to_assign.res_name;
    my_particles = to_assign.my_particles;
    my_bonds = to_assign.my_bonds;
    my_angles = to_assign.my_angles;
    my_dihedrals = to_assign.my_dihedrals;
    return *this;
  }
};

struct s_lj_param
{
  double epsilon;
  double sigma;
  std::string atom_kind_name;
};

struct s_bond_param
{
  std::string atom_1;
  std::string atom_2;
  double bond_coeff;
  double default_length;
};

struct s_angle_param
{
  std::string atom_1;
  std::string atom_2; 
  std::string atom_3;
  double angle_coeff;
  double default_angle;
};

struct s_dih_param
{
  std::string atom_1;
  std::string atom_2; 
  std::string atom_3; 
  std::string atom_4;  
  std::vector<double> dih_coeff;
  std::vector<unsigned int> n;
  std::vector<double> delta;
};

struct s_lookup_tab {
  std::string name;
  int code;
};

#endif /*_COMMON_H*/

这是我为将 t_molecule 类型的 var 添加到分子数组的调用（请参阅上面的标题以了解 t_molecule 的定义）。

    void Molecule_Manager_Main::add_molecule(const t_molecule new_molecule)
{
    std::cout << "TYPE :" << new_molecule.res_name << std::endl; 
    std::cout << "3: BOND PARTICLE 1 : "
      << new_molecule.my_bonds[new_molecule.my_bonds.size()-1].particle_1->name
          << std::endl;  
    std::cout << "3: BOND PARTICLE 2 : "
    << new_molecule.my_bonds[new_molecule.my_bonds.size()-1].particle_2->name
          << std::endl; 
    std::cout << "3: BOND ITER CONST : "
    << new_molecule.my_bonds[new_molecule.my_bonds.size()-1].my_bond_kind_iter->bond_coeff
          << " "
    << new_molecule.my_bonds[new_molecule.my_bonds.size()-1].my_bond_kind_iter->default_length
          << std::endl;
    my_molecules.push_back(new_molecule);
    std::cout << "99: INDEX : " << my_molecules.size()-1 << std::endl;
    std::cout << "TYPE :" << my_molecules[my_molecules.size()-1].res_name << std::endl; 
    std::cout << "4: BOND PARTICLE 1 : "
          << my_molecules[my_molecules.size()-1].my_bonds[my_molecules[my_molecules.size()-1].my_bonds.size()-1].particle_1->name
          << std::endl;  
    std::cout << "4: BOND PARTICLE 2 : "
    << my_molecules[my_molecules.size()-1].my_bonds[my_molecules[my_molecules.size()-1].my_bonds.size()-1].particle_2->name
          << std::endl; 
    std::cout << "4: BOND ITER CONST : "
    << my_molecules[my_molecules.size()-1].my_bonds[my_molecules[my_molecules.size()-1].my_bonds.size()-1].my_bond_kind_iter->bond_coeff
          << " "
    << my_molecules[my_molecules.size()-1].my_bonds[my_molecules[my_molecules.size()-1].my_bonds.size()-1].my_bond_kind_iter->default_length
          << std::endl;
  add_performed = true;
}

这完美地工作...... resname 字符串打印，并且债券向量中最后一个债券的信息打印。然后，一旦我添加了所有分子。我称之为：

t_molecule * Molecule_Manager_Main::get_molecule(unsigned int index)
{
    std::cout << "TYPE :" << my_molecules[index].res_name << std::endl; 
    std::cout << "5: BOND PARTICLE 1 : "
      << my_molecules[index].my_bonds[my_molecules[index].my_bonds.size()-1].particle_1->name
          << std::endl;  
    std::cout << "5: BOND PARTICLE 2 : "
    << my_molecules[index].my_bonds[my_molecules[index].my_bonds.size()-1].particle_2->name
          << std::endl; 
    std::cout << "5: BOND ITER CONST : "
    << my_molecules[index].my_bonds[my_molecules[index].my_bonds.size()-1].my_bond_kind_iter->bond_coeff
          << " "
    << my_molecules[index].my_bonds[my_molecules[index].my_bonds.size()-1].my_bond_kind_iter->default_length
          << std::endl;
  return &(my_molecules[index]);
}

这在债券线上出现了段错误。

我可以从我在添加步骤中打印的索引中看出我没有覆盖我推到向量上的分子（大小正在增长）..

换句话说，似乎正在发生的是：读取子向量（工作）->在父向量中添加更多项目->重新读取子向量（seg-faults）

这些函数是将分子变量添加到向量中的唯一方法，并且分子变量仅添加一次，并且在我当前的测试中不会在死后修改。

有任何想法吗？？？？先感谢您！！

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4 回答 4

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刚刚读到您访问了一个名为 my_bond_kind_iter 的变量。在父向量中添加更多项目后，它将调整大小。这意味着（假设您没有 C++0x 右值感知容器）子向量也将被复制，从而使所有现有的指针和对它的引用无效。因此，当您尝试访问这个现在完全无效的旧迭代器时，您好，分段错误。如果您在子向量中添加更多内容，这当然也会发生。

向量迭代器不安全，您不能保留它们并在以后访问它们，因为向量会调整大小，这意味着移动内存，而这发生在实现的一时兴起。

于 2010-06-28T22:40:29.657 回答
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在不同的对象中，您存储迭代器以访问某些向量中的元素。当底层向量被修改时，这些迭代器会失效，例如通过添加新元素。取消引用这样的迭代器是未定义的行为。

当您添加新分子并稍后使用这些迭代器时，您可能会修改已存储迭代器的向量会导致分段错误。

于 2010-06-28T22:44:49.247 回答
0

我会是你，我会大量重构这段代码。

大多数时候，当我遇到像您这样的问题时（并且变得非常罕见），我会重构代码，直到我清楚地看到问题为止。在这里，有太多的重复显然是可以避免的。使用 typedefs、references、consts 来避免重复。

重构允许你重新组织你的代码和你的想法，简化，让问题变得明显。花点时间去做这件事，你就会找到问题的根源。

这可能超出了这段代码。

（关于重构，我建议阅读：http: //sourcemaking.com/refactoring）

于 2010-06-28T22:48:59.453 回答
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我建议在编写跟踪代码时避免使用下标运算符（例如 my_molecules[index]）（但不限于跟踪代码），更喜欢 at() 成员函数。

于 2010-06-28T22:58:16.827 回答