当我做我的捷运时,我遇到了两个错误:
[1] "error code = 0" and Error in indval.default(Ynode, clustering = clustnode, numitr = 1000):所有物种必须至少出现在一个地块中。有谁知道为什么?我检查了一下,我所有的物种都有丰富的> 0 ...
MRTtest=mvpart(vegetation~ Placette+ Tourb + Transect + Largcanal + Annouvert + Elevation + Profnappe + Litiere+ Solnu+ Deblign+ Densiometre+ EpaissMO+ Vonpostvingt+ Vonpostsoixante+ Pyrovingt+ Pyrosoixante+ Sommesurfterr,tot,margin=0.08,cp=0,xv="pick",xval=10,xvmult=150,which=4,pca=F)
X-Val 代表:1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 4 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150
最小树大小 tabmins 2 3 4 6 2 125 5 18
MRTtest1=MRT(MRTtest,percent=10,species=colnames(vegetation)) summary(MRTtest1) 每个特定节点的物种解释的偏差部分 (%)
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ ~~~~ --- 节点 1 --- 复杂度(R2) 14.87422 Sommesurfterr>=6.024 Sommesurfterr< 6.024
~ 判别物种: THOmtot THOmtot % of expl. 偏差 17.61057298 38.419650816 左侧均值 0.37621604 0.430818462 右侧均值 0.08877576 0.006259911 [1] “错误代码 = 0”
~ 该节点的 INDVAL 物种::左边是 1,右边是 2 簇指示符_值概率 THOmtot 1 0.9597 0.001 THOnmtot 1 0.7878 0.001 LEG 1 0.5802 0.031 LIB 1 0.5078 0.010 MELnmtot 1 0.4710 0.0447 EPNnm0.026
概率总和 = 87.497
指标值之和 = 30.02
重要指标值之和 = 12.67
重要指标数 = 29
重要指标分布
1 2 8 21
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ ~~~~ --- 节点 2 --- 复杂度(R2) 7.920283 Densiometre< 19.88 Densiometre>=19.88
~ Discriminant species :
TRA THOmtot
% of expl. deviance 10.54536819 27.8848051
Mean on the left 0.02754503 0.5158733
Mean on the right 0.20823621 0.2220475
indval.default(Ynode, clustering = clustnode, numitr = 1000) 中的错误:所有物种必须至少出现在一个地块中