r - 将 R 中现有包的函数与 SparkR 一起使用时出错

Question

因此，我使用链接上给出的步骤安装了 SparkR：“ https://amplab-extras.github.io/SparkR-pkg/ ”。我已经使用网站上给出的直接命令从 Github 存储库安装了它。现在，这是我的代码：

library(SparkR)
sc <- sparkR.init(master="local")
files <- paste0("NP",1:10,".txt")
func.clique <- function(file)
{
    w <- read.table(file)
    g <- graph.edgelist(cbind(as.character(w$V1),as.character(w$V2)))
    plot(g)
    cli <- cliques(g)
    return (cli)
}
includePackage(sc, igraph)
cliquevalues <- sapply(files,func.clique)

igraph现在，当我直接使用该库时，这段代码工作得非常好（在 RStudio 中没有 SparkR 命令） 。但是现在，当我执行它时，它说，Error in FUN(X[[i]], ...) : could not find function "graph.edgelist". 这可能是什么原因？我试过把它includePackage放在几个地方，但似乎没有帮助。请帮忙！谢谢。

Answer 1

我会尝试将library(igraph)其他不属于基本包的库放在闭包函数中。就像是：

func.clique <- function(file) {

    library(igraph)

    w <- read.table(file)
    g <- graph.edgelist(cbind(as.character(w$V1),as.character(w$V2)))
    plot(g)
    cli <- cliques(g)
    return (cli)
}