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我正在尝试在 RStudio 和 Rmarkdown 中进行一些可重复的研究。主要是因为我懒得一遍又一遍地将数字粘贴到 powerpoint 或 word 中。 咧嘴笑

我认为对于可重复研究非常重要的一件事是准确记录生成报告的 RMarkdown 文档的哪个版本。通常，此类文档会经过多次修订，此外，它们可能会从存储库中提取多个其他源文件或数据。因此，插入 git commit SHA，并记录存储库是干净还是脏。

但是尽管 RStudio 知道 git，它似乎并没有通过任何 API 调用提供这些信息。还是我错过了什么？

除了手动掏出 git 之外，我还有什么选择？

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我认为 RStudio 也不提供此信息，但您可以通过这样的system调用轻松检索它，例如：

docVersion <- system("git log -n 1 --pretty=oneline", intern = TRUE)
repoStatus <- system("git status -s", intern = TRUE)

您只需要指定您想要的格式，git log并且可能会稍微摆弄一下git status以获得您想要的确切信息。

于 2015-06-18T11:57:40.317 回答