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我有一个使用图形工具生成的过滤图形GraphView()

g = gt.GraphView(g, vfilt= label_largest_component(g, directed=False))

原始图g有 10,069 个顶点,而结果图有 9,197 个。但是,使用新的(过滤的)图表,当我使用 列出入度时indeg = g.degree_property_map("in"),in 中的元素总数list(indeg.a)仍然是 10,069。这在绘制具有 9,197 个节点的新过滤图时会出现问题,其中顶点大小设置为 的函数indeg,主要是因为元素数量不匹配。

代码片段看起来像这样

g = load_graph("ppnet.xml")
g = GraphView(g, vfilt=label_largest_component(g, directed=False))
indeg = g.degree_property_map("in")
indeg.a = np.sqrt(indeg.a) + 2
graph_draw(g, vertex_size = indeg, vertex_fill_color=indeg, pos = sfdp_layout(g),
    vcmap=plt.cm.gist_heat, output_size=(400, 400), output="gc.png")

运行时,给出以下ValueError

ValueError: operands could not be broadcast together with shapes (10069,) (9197,) 

GraphView对象添加预期样式的正确方法是什么?

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找到了解决方案。我首先创建了对象的副本GraphView,然后清除了该副本的顶点。请注意,为了清楚起见g,我引入了一个新变量,而不是保留变量名称gc

g = load_graph("ppnet.xml")
gc = GraphView(g, vfilt=label_largest_component(g, directed=False)).copy()
gc.purge_vertices()
indeg = gc.degree_property_map("in")
indeg.a = np.sqrt(indeg.a)+2
graph_draw(gc, vertex_size = indeg, vertex_fill_color=indeg, pos = sfdp_layout(gc),
    vcmap=plt.cm.gist_heat, output_size=(400, 400), output="gc.png")
于 2015-06-15T09:35:54.387 回答