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我想执行一个非常大的 bigmemory big.matrix B的转置，以便我可以计算AB T。这在大内存中可能吗？更重要的是，我怎样才能找到有关此的文档？在这篇关于 bigmemory 的论文的第 5 页http://www.stat.yale.edu/~mjk56/temp/bigmemory-vignette.pdf上，作者说该包还支持诸如 prod()、colmean()、colsd 等操作() 等，但我找不到关于此的文档。

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该文档在这一点上相当陈旧，并且正在迅速变得越来越老旧。我是 bigmemory 软件包的当前开发人员之一。我们已经开始对 bigmemory 包进行很多新的更新，以使其更加现代和易于使用。我们希望尽快向 CRAN 发布新的更新版本。

也就是说，转置功能实际上是bigalgebra包的一部分。目前，它正在大力开发中，我一直在努力扩展功能以包含更简单的功能，例如t. 公平的警告，你很有可能会发现一两个错误。因此，在这里谈论太多可能是一个潜在的解决方案。

安装我当前的开发分支bigalgebra

library(devtools)
# probably also install dev bigmemory
# install_github("kaneplusplus/bigmemory")
install_github('cdeterman/bigalgebra')

这将为您提供对象的t方法big.matrix。 

library(bigalgebra)
set.seed(123)
bm <- as.big.matrix(matrix(rnorm(25), nrow=5))
bm[]
            [,1]       [,2]       [,3]       [,4]       [,5]
[1,] -0.56047565  1.7150650  1.2240818  1.7869131 -1.0678237
[2,] -0.23017749  0.4609162  0.3598138  0.4978505 -0.2179749
[3,]  1.55870831 -1.2650612  0.4007715 -1.9666172 -1.0260044
[4,]  0.07050839 -0.6868529  0.1106827  0.7013559 -0.7288912
[5,]  0.12928774 -0.4456620 -0.5558411 -0.4727914 -0.6250393

t(bm)[]
           [,1]       [,2]       [,3]        [,4]       [,5]
[1,] -0.5604756 -0.2301775  1.5587083  0.07050839  0.1292877
[2,]  1.7150650  0.4609162 -1.2650612 -0.68685285 -0.4456620
[3,]  1.2240818  0.3598138  0.4007715  0.11068272 -0.5558411
[4,]  1.7869131  0.4978505 -1.9666172  0.70135590 -0.4727914
[5,] -1.0678237 -0.2179749 -1.0260044 -0.72889123 -0.6250393

一个后续点，您似乎对tcrossprod两个矩阵特别感兴趣。我会记住这一点，以便在bigalgebra包中创建相应的绑定。

于 2015-06-02T19:05:32.477 回答