sql - 找到两个数据框之间的部分匹配

Question

我有两个数据框。

head(NEexp)
 Gene   Transcript Ratio_log2      FDR
HLHmgamma HLHmgamma-RA   3.759200 1.09e-10
Brd       Brd-RA   3.527000 2.66e-08
CG4080     CG4080-RE   3.378500 2.95e-50
RpII215   RpII215-RA   3.343967 1.82e-10

head(excel$gene)
Enhancer of split mgamma, helix-loop-helix
distal antenna
CG4080 gene product from transcript CG4080-RB

如您所见，两个基因列部分匹配（HLHmgamma 匹配分裂 mgamma 的增强子，螺旋-环-螺旋；CG4080 匹配来自转录本 CG4080-RB 的 CG4080 基因产物），无论如何我可以将这两者联系起来吗？到目前为止我尝试过的代码：

genename=as.character(NEexp$Gene)
query=paste("select * from excel where excel.gene LIKE \"", genename,"\ ",sep"")
Newtable<-dbGetQuery(con,query)

dbGetQuery(con,"select * from excel, NEexp where excel.gene LIKE % "NEexp$Gene" %")

Answer 1

You need merge，这与 SQL 中的基本相同join。但首先你可能想要拆分excel$gene以获得你想要匹配的部分。

http://stat.ethz.ch/R-manual/R-devel/library/base/html/merge.html

https://stat.ethz.ch/R-manual/R-devel/library/base/html/strsplit.html